1. 样品质控
2. qPCR反应体系及条件
反应体系以20µL为例PCR仪设置以 ABI 7500为例,其他型号定量PCR仪应通过标准品进行参数校正或咨询专业技术人员。
【基线设置】
内参基线设定:以标准品基线设定内参基线,将内参的基线设定为6~12个循环。
端粒基线设定:以标准品基线设定端粒基线,将端粒的基线设定为3~7个循环。
【阈值设置】
内参阈值设定:以标准品CT值设定内参扩增曲线阈值,将内参的CT 值定为17±1。
端粒阈值设定:以标准品CT值设定端粒扩增曲线阈值,将端粒的CT 值定为12±1 。
说明:
(1)如果标准品的内参CT值>25,但阴性对照管的内参CT值正常, 表明试剂盒扩增效率下降或
仪器运行障碍。
(2)如果阴性对照管的内参或端粒CT<25,表明在环境或加样过程中存在轻微污染。
备注:
1. 样本检测以及标准品的使用应做技术上三重复,阴性对照做单重复。
2. 如果检测样本为血液DNA,可以将所得端粒相对长度在上海翼和应用生物技术有限公司构建
的1500例中国人群数据库比对,评估样本个体端粒的相对长度;若选用其他样本,建议自行构
建数据库并做进一步分析。
3. 端粒长度计算方法(T/S):先分别计算标准品与样品的△CT=CT(端粒)-CT(内参)
再计算 T/S=2-(△CT(样品)-△CT(标准品))
注:T为待测样品,S为标准品,T/S为待测样品与标准品的端粒相对长度比