“深度血液”辅助血液生物标志物开发
浏览次数:989 发布日期:2022-11-8
来源:中科新生命
什么是生物标志物
血液是临床最普遍的样本类型,血液生物标记物被用于对患者进行分类和支持治疗决策。然而,现有的生物标记物远远不够全面,往往缺乏特异性,新的生物标记物的开发速度非常缓慢。基于质谱(MS)的蛋白质组学已经成为生物研究中的一项强大技术,它现在可以对血浆蛋白质组进行深度检测。
生物标志物的筛选方法
传统的“三角法”通过在小队列中发现候选生物标志物,然后在更大的验证队列中进行下一步的验证和确证。此外,
Matthias Mann等研究者还提出了一种“
矩阵法”,基于大队列蛋白质组筛选和验证同时分析,避免了传统法样本个体差异的缺陷,省时省力且更科学地解决问题。
DOI: 10.15252/msb.20156297
血液生物标志筛选难点
血液由于其蛋白分布动态范围广(跨越12个数量级)、蛋白含量分布不均匀(高丰度占比>90%),且质谱的灵敏度有限的原因(目前不做处理的质谱检测范围仍然高及中丰度蛋白为主),因此血液蛋白组学,尤其是发挥功能性作用的低丰度蛋白的检测存在着极大的挑战。
DOI: 10.15252/msb.20156297
“深度血液”数据分享
1、超高鉴定深度
中科新生命新推出的深度血液4D-DIA蛋白组采用最新的
富集方法+DIA全息扫描+ Spectronaut 16权威分析软件,实现了血液中低丰度蛋白的超高深度鉴定。实测项目,鉴定蛋白数超
3000+,中低丰度蛋白覆盖率约占
95%~。
此外,“深度血液”与其他传统血液蛋白组学的方法比较分析,也显示出了其高深度的特色。如下图所示,“深度血液”的鉴定深度远高于传统血液蛋白组学——“去高丰度+DIA”和“去高丰度+TMT”,并且队列样本(n=40)覆盖人类血浆蛋白质库中高达
72%的蛋白。
https://www.proteinatlas.org/humanproteome/blood+protein
2.兼具超高稳定性、重复性与可靠性
“深度血液”采用DIA全息扫描模式,具有超高的稳定性和重复性。中科新生命的实测数据显示,三次技术的定性重复性达
90%,定量相关性达
0.9,在色谱稳定性的评价中,多维度质控均达到了高标准的水平,进一步证实了结果的稳定性和可靠性。
定性重复性达 90% 定量相关性达 0.9
3. 项目经验丰富,高分文献发表10篇有余
中科新生命至今已经完成了
10000+样本的质谱检测,且样本类型涉及血液、动植物组织、外泌体等多种类型,项目经验丰富。近年来,中科新生命助力发表的DIA文献已达
10篇有余,部分DIA客户文献请见下表。
“深度血液”年底大促销
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