致病微生物系列
致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒(PCR法)
致泻大肠埃希氏菌鉴定剂盒参照《GB4789.6—2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 致泻大肠埃希氏菌检验》进行设计,可针对食品样品中的致泻大肠埃希氏菌特异核酸片段进行扩增,通过电泳判断样品的鉴定结果。该产品检出限为10^3 cfu/ml(使用旋达071021M细菌基因组DNA提取试剂盒提取1 ml 10^3cfu/ml增菌液的细菌基因组DNA作为模板)。
一管式检测试剂为本公司研发的产品,与传统PCR法检测试剂具有等效的检测性能,其中的固封液不影响检测反应与荧光检测性能,并且对试剂蒸发与气溶胶污染起到一定的防范作用。该产品无需分装试剂,有效减少反复冻融及分装过程中造成的试剂活性下降及试剂污染,无需增设试剂配置区,省时省力省空间。(该产品反应液中已含荧光染料,可直接使用荧光定量PCR仪进行定性检测)
◆ 产品组成(96测试)
试剂 |
含量 |
作用 | |
孔1 |
反应液-uidA |
23μl/孔 12孔/排 8排 (本产品使用12联PCR管分装,每排含12种反应液各23ul) |
内参 |
孔2 |
反应液-ipaH |
鉴定EIEC | |
孔3 |
反应液-pic |
鉴定EAEC | |
孔4 |
反应液-aggR |
鉴定EAEC | |
孔5 |
反应液-astA |
鉴定EAEC | |
孔6 |
反应液-stx1 |
鉴定EPEC与EHEC | |
孔7 |
反应液-stx2 |
鉴定EPEC与EHEC | |
孔8 |
反应液-bfpB |
鉴定EPEC与EHEC | |
孔9 |
反应液-escVa |
鉴定EPEC与EHEC | |
孔10 |
反应液-lt |
鉴定ETEC | |
孔11 |
反应液-stp |
鉴定ETEC | |
孔12 |
反应液-sth |
鉴定ETEC | |
NG-Ecoli |
100μL × 1支 |
阴性对照 | |
NG-DW |
100μL × 1支 |
空白对照 | |
PG-Ecoli |
100μL × 1支 |
阳性对照 | |
Loading Buffer |
600μL×1支 |
电泳上样缓冲液 |
◆ 所需仪器
ABI ,BioRad,TaKaRa等PCR扩增仪,电泳仪,凝胶成像仪等电泳配套设备。(使用荧光定量PCR仪进行定性判读时则无需电泳设备)
◆ 自备耗材和仪器
①灭菌1.5mL或2.0mL离心管;②冰盒;③移液器(1-10μL,10-100μL,100-1000μL)及配套灭菌吸头;④离心机;⑤涡旋混匀器;⑥金属浴。
◆ 样品处理
参照《GB4789.6—2016 食品安全国家标准 食品微生物学检验 致泻大肠埃希氏菌检验》中的操作步骤进行前增菌。建议使用试剂配套细菌基因组DNA提取系列产品。
◆ 实验操作
1.添加模板(样本制备区,放置于冰盒中进行)
取所待检样品数+3的12联反应管,将试剂完全解冻,分离心30s。离心后揭开封口膜,使用穿刺加样法穿过固封层向每管反应液中分别加入2μL模板(或直接使用无菌吸头挑取少许待检菌落至反应管中)。
加样示例:(有2个待测样品)
取5排12联反应管,按顺序第一排全部加NG-DW,第二排全部加NG-Ecoli,第三排全部加样品1,第四排全部加样品2,第五排全部加PG-Ecoli。
盖好配套的PCR管盖后,涡旋混匀30s,离心1min,立即进行PCR扩增反应。
2. 扩增反应(扩增及产物分析区)
按下列条件设置扩增反应:(如需使用荧光法进行检测请选择FAM通道)
PCR循环 |
荧光收集位点 | ||
95℃ |
10分钟 |
1个循环 |
— |
95℃ |
30秒 |
30个循环 |
— |
63℃ |
30秒 |
— | |
72℃ |
90秒 |
※ | |
72℃ |
5分钟 |
1个循环 |
— |
3. 产物电泳(扩增及产物分析区)
称量4. 0g琼脂糖粉,加入至200 mL的1×TAE电泳缓冲液中,充分混匀。使用微波炉反复加热至沸腾,直到琼脂糖粉完全融化形成清亮透明的溶液。待琼脂糖溶液冷却至60℃左右时,加入溴化乙锭( EB )至终浓度为0.5μg/mL,充分混匀后,轻轻倒入已放置好梳子的模具中,凝胶长度要大于10cm,厚度宜为3mm~5mm。检查梳齿下或梳齿间有无气泡,用一次性吸头小心排掉琼脂糖凝胶中的气泡。当琼脂糖凝胶完全凝结硬化后,轻轻拔出梳子,小心将胶块和胶床放入电泳槽中,样品孔放置在阴极端。向电泳槽中加入1×TAE电泳缓冲液,液面高于胶面1mm~2mm。将 5μL PCR产物与1μL 6×上样缓冲液混匀后,用微量移液器吸取混合液垂直伸入液面下胶孔,小心上样于孔中;阳性对照的 PCR 反应产物加入到最后一个泳道;第一个泳道中加入 2 μ L 分子量 Marker 。接通电泳仪电源,根据公式:电压=电泳槽正负极间的距离(cm)×5V/cm计算并设定电泳仪电压数值;启动电压开关,电泳开始以正负极铂金丝出现气泡为准。电泳30min~45min后,切断电源。取出凝胶放入凝胶成像仪中观察结果,拍照并记录数据。
进行电泳检测时,需对比Marker进行判断,当目的靶标对应位置出现单一显著条带时可判断该靶标为阳性;否则为该靶标检测为阴性。(使用荧光定量PCR仪检测时,检测孔Ct≤30时判断该孔为阳性;当检测孔Ct>30时,该检测孔为阴性)
示例电泳图
需同时满足:1.空白对照中所有泳道均为阴性;2.阴性对照中uidA泳道阳性,其余泳道阴性;2.阳性对照中所有泳道阳性,此时可判断实验有效。如无法满足上述条件,则实验无效,需重复实验;如重复后结果仍为无效,请于本公司技术支持联系。
在实验有效的情况下,可根据下表进行判读:
致泻大肠埃希氏菌类别 |
目标条带的种类组合 | |
EIEC |
ipaH(+) |
uidA (+/-) |
EAEC |
aggR,astA,pic中一条或一条以上阳性 | |
EPEC |
bfpB(+/-),eae(+),stx1(-)stx2,(-) | |
STEC/EHEC |
stx1,stx2中一条或一条以上阳性,eae(+/-),bfpB(-) | |
ETEC |
lt,stp,sth中一条或以上阳性 |
◆ 注意事项
1.本试剂检测灵敏度高。为了防止污染,实验要分区操作。
1)第一区:样本制备区。
2)第二区:扩增及产物分析区。
★ 分区之间最好进行物理性隔离,避免人为因素造成的污染。
2. 实验过程中穿戴工作服和乳胶手套,使用移液器,试验产生的所有废弃物及时处理。
3.严格按照操作步骤操作,试剂配制和加样等步骤请严格按照说明书要求在冰上操作。
4.反应液中的成分对光敏感,应避光保存。试剂使用前要完全解冻,但应避免反复冻融,推荐使用前离心30秒。
5.不同批号试剂请勿混合使用,在有效期内使用。