蛋白分离、杂交、检测、分析
前瞻回顾
鉴于小编在《Azure Biosystems Western Blotting工作流程之实验方法的选择》中和大家聊了Western blot的实验方法选择,相信大家已经将您的western blot 实验方法选择好了,那么这期小编和大家聊聊western blot的实验流程中的那些事。
蛋白分离
电泳准备?
玻璃配胶板要清洗干净,以免引起配胶问题,影响蛋白分离
配胶液要充分混匀,凝聚时间要够,如胶凝聚不均匀,会造成胶分辨率差。出现笑脸皱眉条带
电泳时,上样体积和浓度最好保持一致,这样可以防止出现条带过宽或者过窄的情况产生
如何选择膜?
膜上有蛋白质的结合位点,可结合从凝胶中转移的蛋白质。常用的膜是硝酸纤维素膜(NC膜)和PVDF膜。
NC膜
低分子量蛋白检测
通常用于化学发光法
蛋白剥离效果不理想
PVDF膜
低表达蛋白结合能力强
通常用于荧光方法(自发荧光背景低)
剥离和二次杂交时,蛋白的截留能力强
如何建立转膜系统
常用的转膜系统形式为 “三明治” 结构,凝胶和膜紧密贴合,放在两张转印滤纸之间,用电极板夹夹住,置于转印buffer中,正负电极通电后,将蛋白质从凝胶转移到膜上。转印滤纸 (滤纸) 能够保持均匀一致的压力,确保膜和凝胶间没有空隙,并保持转移buffer充盈在“三明治”结构中蛋白完全从凝胶转移至膜上。
Blot前准备什么?
当优化转印设置、条件及实验时,最重要的是确定样品中所有蛋白是否从胶上完全转移到膜上。使用SelfStainTM免染胶来显示膜上的所有蛋白 ,并立即进行western blot后续步骤。
膜封闭
封闭目的是防止非特异性结合,降低背景对目的信号的干扰。如使用脱脂奶粉做封闭液,最好将脱脂奶粉进行滤膜过滤,这样可以减少后期颗粒背景的产生。
一抗孵育
确保新的一抗浓度经过优化。如有确证过的一抗,可尝试将一抗标记荧光染料,直接进行一步法Western blot检测。
洗膜和二抗孵育
每次孵育后,洗去多余的抗体对于降低背景信号至关重要。荧光方法Western blot中,洗膜还可以去除有自发荧光的去垢剂。洗膜的时候如果多张,建议分开进行清洗,同时洗膜液体积不能太少。
化学发光检测
尝试不同的底物增加灵敏度和信号持久性;化学发光底物使用前需要平衡至室温,可以增加酶的活性;数字成像系统要灵敏度很高。
荧光检测
保持所有物品的清洁,确保无背景干扰;印迹膜避光保存;使用背景淬灭板降低背景荧光,增强信噪比。
检测
Azure Biosystems c系列成像系统
Azure c 系列成像系统提供 4 款性能卓越的 Western blot 成像系统。可以选择满足现有实验需求的型号,当需要提升应用范围时,通过升级即可完成
分析
AzureSpot分析软件
AzureSpot 分析软件作为分析胶和膜的工具,把复杂的分析变得简单化。
1.在样品上进行泳道划分 2.设置阈值,检测条带
3.扣除背景,提供有多种背景扣除方法可选
4.查看结果,可作出修改或对任意条带边界进行编辑
5.使用标准分子量marker来确定样品的分子量,或者使用标准品来确定浓度