全转录组测序

欧易特色

● 丰富的建库经验，优秀的建库质量：12年文库构建技术沉淀，具有极强的复杂样品处理能力和丰富的建库经验
● 临床研究级数据产出，质量和数量完美结合：国内唯一获得美国CLIA认证的测序实验室，全程采用精益管理和5S实验室规范 
● 结合客户的需求，灵活进行定制化信息分析
● 独具特色的高级分析：lncRNA调控机制预测，lncRNA和mRNA的共表达分析，lncRNA、mRNA和circRNA的联合分析等

推荐测序模式

● Hiseq4000，PE150 
● 一般测序：12 Gb/样本 
● 深度测序：20 Gb/样本

数据分析内容

标准数据分析

● 原始测序数据质控   ● 测序数据质量评估   ● Reads污染检测   ● 参考基因组比对

● QC分析  ● mRNA分析（转录本/基因表达丰度分析、差异表达转录本分析） 

● lncRNA分析（转录本重建/组装分析、潜在长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA挖掘、长链非编码RNA特征分析、lncRNA表达量分析、差异lncRNA表达分析）

● circRNA分析（circRNA鉴定、cirRNA来源基因注释、circRNA基因结构分析、circRNA表达丰度分析、circRNA差异表达分析）

高级数据分析

● mRNA分析

● lncRNA分析

● lncRNA分析

● circRNA分析 （circRNA-mRNA互作分析、互作网络图绘制）  ● ceRNA分析 ● WGCNA分析
 

全转录组测序样品要求

● Total RNA：≥4 μg 

● OD260/280为1.8-2.2

● 适用范围：有参考基因组物种