根据目的蛋白序列特点，选用合适的蛋白酶进行酶解。对单一蛋白进行高灵敏度，高密度的液质联用分析。
在对目的蛋白达到高覆盖度鉴定的同时，从大量的非修饰肽段中，分离和鉴定到极微量的修饰型肽段。
蛋白组学软件辅以人工验证，保证了修饰位点的准确性，有效的排除软件不能辨别的假阳性结果。
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杭州景杰生物科技有限公司（PTMBiolabs,Inc.）是一家成立于2010年的创新型高新技术企业，座落于风景秀丽的钱塘江畔，是杭州市大力引进的海外高层次留学归国创业企业。公司现有员工50余人，其中具有海外名校留学背景的博士博士后10人，本科以上科技人员占90%以上。
公司是目前国内唯一以个体化医学-表观遗传学前沿研究领域为科学背景的，集研发、生产和服务于一体的创新型生物高科技企业。建有全球独一无二的“组学试剂+组学技术+组学分析“有机整合的”一站式“高端技术平台，致力于在个体化医学领域开展重大疫病的新型生物医学检测试剂、疾病诊断试剂、药物开发与筛选试剂的研发与生产；同时提供蛋白质修饰底物高通量鉴定、定量分析、生物标志物鉴定与药物靶点筛选的研发合作与技术支持。
基于公司雄厚的学术背景、领先的科研实力、良好的经营业绩以及广阔的发展前景，杭州景杰生物科技有限公司得到了各级政府的充分肯定和大力支持。先后被授予浙江省钱江人才、杭州市全球引才“521“计划、杭州市”115“引进国外智力计划等多项荣誉，并联合承担了”十二五“国家新药创制重大计划、国家自然科学基金等一批重大科研项目。
人类基因组的解码开创了以基因解析为特征的个体化医学新时代。然而，基因型与疾病表型的不相关性揭示出个体化医学的本质在于疾病最相关的功能分子----蛋白质。蛋白质修饰（ProteinPost-translationalModification,PTM）是蛋白质行使功能的最高级形态，是表观遗传现象的核心内容。因此，以蛋白质修饰-表观遗传为特征的生物医学研究是个体化医学领域的最前沿。
蛋白质修饰与表观遗传学是生物医学最前沿的研究领域，是21世纪生命科学与生物技术产业化的战略前沿和主要突破口。不久前，国际人类蛋白质组组织宣布全面启动“国际人类蛋白质组计划（HPP）”，其实施势必全面带动科学技术及生物产业的发展。在国际上，以蛋白质修饰与表观遗传为特征的靶向性抗肿瘤药物开发是个体化医学的核心内容，是跨国制药公司与著名药物研发中心争相投入的领域。
个体化医学和蛋白质组学是我国重点支持的科学研究与科技产业发展方向，2006年发布的《国家中长期科学和技术发展规划纲要（2006—2020）》明确宣示在国家政策层面上重点支持个体化医学和蛋白质组学研究与产业化转化。2011年科技部《关于印发医学科技发展“十二五”规划的通知》（国科发计[2011]552号）明确指出蛋白质组学技术和个体化诊疗技术为“十二五”发展重点。中国健康促进基金会和国家发改委等五部委也先后启动了个体化医学专项资助项目（中国健康促进基金会[2011]002号）和蛋白类生物药和疫苗发展专项（发改办高技[2012]3420号）。
