产品及特点 |
易错PCR(Error-Prone PCR)是利用天然Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校对功能的特性,在一定条件下(如不同的dNTP浓度、Mg浓度和MnCl2存在)能够按较高的机率引入随机引入突变而设计。如果有适当的突变选择方法,则可从构建的突变库选出所需突变体,用于人工诱变。但是易错PCR在操作中最大的问题是最佳PCR循环数的摸索,循环次数太多或太少,都得不到成形的突变DNA条带,影响后续的DNA回收和克隆步骤。为克服此缺点,本公司开发了染料法实时易错PCR产品,它具有下列特点:
- 即开即用,十分简单方便。
- 可以实时监控PCR的进行,用户可以不需要任何摸索就能在最佳时候(荧光信号刚进入平台期)停止PCR,立即进行电泳,回收到突变DNA。
- 配方经过精心优化,突变率稳定,在0.66%左右(±0.13%)。主要引入点突变,一般不会引入插入或缺失突变。
- 比体内基因突变更快捷简单,但如果在PCR引物中设计位点,则可使产物克隆到表达载体,也可以用于体内蛋白活性的筛选。
- 可用于连续易错PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易错PCR的产物用作下一次易错PCR的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
- 只适用于扩增1kb以下的产物,对于1kb以上的产物,建议分段扩增。
- 本产品足够100次30 mL体系的染料法实时易错PCR反应。
- 本产品只能用于科研。
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规格及成分 |
成份 |
编号 |
规格 |
包装 |
10×染料法实时易错PCR Mix(含酶) |
230712a |
300 mL |
0.5mL红色盖 |
易错PCR专用dNTP |
220167b |
300 mL |
0.5mL黄色盖 |
易错PCR增强剂 |
220167c |
300 mL |
0.5mL白色盖 |
追加dNTP,0.5mM |
220167d |
300 mL |
0.5mL本色管 |
易错PCR专用MnCl2 |
220167e |
300 mL |
0.5mL绿色盖 |
使用手册 |
220167sc |
1份 |
无 |
本产品使用五孔盒包装 |
运输及保存 |
低温运输,-20℃保存, 有效期为一年。 |
自备试剂 |
引物、DNA模板、超纯水。 |
使用方法 |
- 将自备的PCR引物稀释到10 mM。引物是决定易错PCR成败的关键因素,设计引物时要保证其Tm在70℃,长度在25-30nt之间,GC含量在45%-60%之间,3端GC含量低,并且没有发夹结构。
- 用自备引物和自备的常规PCR试剂扩增制备易错DNA模板(常规PCR产物),胶回收并准确确定浓度。注意:易错PCR的模板一定要用胶回收的常规PCR产物,因为胶回收可以把电泳不可见的非特异性扩增片段去除,否则这些片段由于也是用易错PCR引物扩增所得,在易错PCR扩增时也会被扩增,产生竞争抑制,降低靶分子的扩增效率。如果常规PCR制备模板的引物和易错PCR引物不同(类似巢式PCR)则可以避免此问题,但需要合成两对引物。本试剂盒只适用于扩增1kb以下的产物,对于1kb以上的产物,建议分段扩增。
- 将回收的DNA片段(模板)用水稀释到1ng/mL 、10ng/mL和100ng/mL三个浓度。注意:模板使用量是影响突变率的最重要因素,因为模板DNA为非突变DNA,扩增产生的DNA为突变DNA,易错PCR体系跟常规PCR一样,最后会达到扩增平台,最终得到的扩增DNA的量是固定的,因此起始模板DNA使用量越大,则突变DNA在最终得到的总DNA中的相对比例就越低。但模板太少又不容易扩增成功,所以建议同时测试三个模板用量。如果都成功,则优先选用模板浓度低的PCR产物进行分析。
- 设置30uL体系的易错PCR反应。在干净的PCR管中,分别加入下列成分。由于Mn离子容易跟其他成分发生沉淀反应,因此上机前最后加MnCl2:
成分 |
管1 |
管2 |
管3 |
10×染料法实时易错PCR Mix(含酶) |
3 mL |
3 mL |
3 mL |
自备DNA模板 |
1 mL(1ng/ mL) |
1 mL(10ng/ mL) |
1 mL(100ng/ mL) |
自备易错PCR引物
(10 mM each) |
各1 mL |
各1 mL |
各1 mL |
易错PCR增强剂 |
3 mL |
3 mL |
3 mL |
易错PCR专用dNTP |
3 mL |
3 mL |
3 mL |
易错PCR专用MnCl2 |
3 mL |
3 mL |
3 mL |
补自备超纯水 |
加到30 mL |
加到30 mL |
加到30 mL |
步骤 |
参数 |
循环数 |
PCR前变性 |
94℃ 3分钟 |
循环1次 |
染料法实时
易错PCR |
94℃ 1分钟 |
循环60次,在72℃时采集Sybr Green I通道的荧光信号 |
60℃ 1分钟 |
72℃ 3-10分钟 |
注:由于易错PCR含高浓度的镁离子,因此引物容易互为模板形成引物二聚体,因此使用60℃为复性温度。在错误碱基掺入后,DNA合成会暂时停滞,因此为了让DNA合成继续,需要延长合成的时间到3-10分钟。易错PCR循环次数越多,突变DNA(扩增产物)与非突变DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突变率和模板长度恒定的情况下,扩增次数越多,发生突变的绝对数就越高,在同一模板上发生的突变位点数就越多。但循环次数过多,又得不到完成的DNA条带,没法进行后续的克隆。所以可以设置60次循环并不表示要完成60次,而是需要在荧光信号不再增长,进入平台期后立即停止易错PCR并进行电泳回收。
- 易错PCR结束后,立即电泳检测。如果扩增产物长度正确,则进行胶回收,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
- 如果没有扩增,则按下列操作进行追加PCR。
- 在易错PCR管中,加入3 mL追加dNTP到27 mL剩下的染料法实时易错PCR体系中,按下表进行追加实时PCR(chasing Real-Time PCR)。
步骤 |
参数 |
循环数 |
追加实时PCR |
94℃ 1分钟 |
循环20次,在72℃时采集SYBR Green I通道的荧光信号 |
60℃ 1分钟 |
72℃ 1分钟 |
- 追加实时PCR荧光信号进入平台期后立即结束PCR,并不需要等到20个循环结束,并进行电泳检测。如果有DNA条带并且长队正确,则再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
- 如果没有预期大小的PCR产物,则需要分析原因。
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可调染料法实时易错PCR试剂盒 |
产品详情:
http://www.tjs.bio/productDetails.html?id=56047
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中文名称:染料法实时可调易错PCR试剂盒
产品编号:230713 规格:100次 目录价:2395元
产品链接:
http://www.tjs.bio/productDetails.html?id=56048
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