数据非依赖型采集模式(Data-Independent Acquisition, DIA)逐渐崭露头角。相较于 DDA 数据采集模式在一级质谱中每个时间窗口采集较高的有限肽段离子(通常是 TOP20)进入二级质谱进行碎裂分析。DIA 将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂及检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。
研究流程
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分析结果
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PCA
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差异蛋白韦恩图
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蛋白网络互作图
案例分析
利用 DIA 技术,研究补体系统与精神异常的关系
Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress
期刊:Molecular Psychiatry 影响因子:11.973
发表时间:2019年 发表单位:爱尔兰皇家外科学院
研究背景
补体级联是免疫系统的重要组成。越来越多的证据表明,补体系统异常与精神疾病有密切关系。
研究目的
为了进一步证明两者之间的关系,研究者对来自于 UK avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC) 队列中的血液样本,进行了 DIA 蛋白质组检测,重点关注其中 29 个补体级联相关蛋白的表达水平。
研究结果
6 个蛋白的表达水平与精神异常相关。利用大鼠慢性应激模型,该研究结果进一步表明:慢性应激可能引起补体通路异常,与精神异常有显著相关性。
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图 1 差异蛋白丰度图
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图 2 通路相关的差异蛋白
参考文献
Föcking, Melanie, Sabherwal S , Cates H M , et al. Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress[J]. Molecular Psychiatry, 2019
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苏州帕诺米克生物医药科技有限公司(简称:诺米代谢)于 2013 年在苏州工业园区成立,是中国最早成立、规模最大的代谢组学公司之一,致力于打造代谢组学精准医学与营养全方案提供商,成为每个人的代谢管家。诺米代谢业务板块包括组学技术服务、临床质谱、组学临床产品与生物大数据平台,为全球客户提供更快更精准的代谢组学技术服务、临床产品及大数据服务。
诺米代谢由“国家千人”计划人才、金鸡湖科技领军人才领衔,创始及核心团队来自于哈佛大学、MD Anderson Cancer Center、UC Davis、加拿大 TMIC、北京大学、中科院等国内外知名高校科研院所,涵盖代谢组学、生物信息学、生物大数据、质谱、药学等领域的科学家团队。诺米代谢在苏州、南京、北京、南昌、成都、金华、东莞的实验室共运行 80 余台全型号进口质谱设备,覆盖代谢组学、蛋白质组学检测服务、临床研发与检验等领域。
基于自身完整的样品预处理平台、高分辨率质谱平台、海量代谢物库与核心匹配算法、临床大队列样本与组学大数据、独家知识产权“全靶”技术平台、及领先的云数据分析系统 BioDeep™ ,诺米代谢已为国内外 400 余家知名科研院所、400 余家三甲医院以及食品与制药企业提供全面、专业的代谢组学技术服务。服务项目囊括非靶向代谢组学、靶向代谢组学、全靶、脂质组学、蛋白组学、风味组学、空间及单细胞代谢组学,应用领域包括农业、环境、食品、营养、肿瘤、心血管疾病、代谢类疾病及肠道微生物相关的研究领域,覆盖 100 余项细分检测分析服务内容,为客户提供个性化的代谢组学科研及临床解决方案。
在质谱精准医学及组学临床方面,诺米代谢有多个创新产品研发管线,涵盖心血管疾病、脑卒中、肿瘤与肠道微生物方向的诊断、辅助诊断、早筛及用药指导应用。 基于自主国际领先的 MetaDiscovery™ 组学临床技术平台,诺米代谢在 2021 年启动和实施了中国 10 万人群前瞻性脑卒中大队列代谢组学研究计划,将持续转化多个临床诊断与早筛产品,着力于利用代谢组学技术降低中国脑卒中的发病率。 诺米代谢目前已获得元生创投、薄荷天使及沃生投资等行业知名基金的多轮投资,并取得科技领 军企业、CMA 认证企业、高新技术企业、江苏省民营科技企业、ISO-9001 质量管理体系认证、 GLP 实验室、第三方医学检验所等资质,知识产权 30 余项,临床注册产品 20 余项。诺米代谢 将在精准医学与精准营养领域持续发力,为健康中国 2030 做贡献。