CNPD 中国天然产物数据库
CNPD™ 产品简介
中国传统中草药的应用已有几千年历史,医药行业对天然产物进行系统地分离和研究也经历了二百多年的历程,从中草药中寻找有 效成份,进而发现有潜力的先导化合物或新药已成为目前新药研究与开发的一个热门领域。中国科学家早在二十世纪三十年代就从 研究中国传统的中药及民间行之有效的民间药入手,利用现代手段对中草药开展了化学、生物学和药理学研究。通过对中草药天然 产物的提取分离,结构鉴定和结构改造,不但创造出来源于中草药又优于其母体结构的先导化合物和新药,并且积累了大量具有很 高科学与应用价值的信息资源。系统地收集、整理和分析这些信息资源,无疑将对天然产物、新药及相关领域的研究起着重要的作用。
中国天然产物数据库 [Chinese Natural Product Database (CNPD™)] 是创腾科技有限公司和中国科学院上海药物研究所联合开发的综合性天然产物数据库。这一数据库是在 ISIS 化学信息管理系统的基础上建立并完成的。ISIS 化学信息管理系统是目前国际通用的管理系统,使用方便,兼容性好。
CNPD™ 是面向相关领域的科学家建立的易于使用的综合性天然产物数据库系统,该产品力图系统的收集、整理、分析从中国国产 的植物中分离鉴定出的天然产物的物理性质、生物活性及化学结构等信息,结合中国传统中草药的应用实践,利用zui先进的计算机化学信息管理手段,为中国的新药、天然产物及相关领域的研究与开发工作,提供一个不可多de的好工具。
生物碱 | alkaloid | 氨基糖甙 | aminoglycoside |
柬 | glycoside | 肽 | peptide |
黄酮 | flavonoid | 多糖 | polysaccharide |
蒽醌 | anthraquinone | 核首 | nucleoside |
菲醍 | phenanthraquinone | 多烯 | polyene |
萘醌 | naphthoquinone | 二烯 | diene |
苯 酉昆 | benzoquinone | 糖 | saccharide |
苯并味晡 | benzofuran | 聚醯 | polyether |
苯并毗喃 | benzopyran | 脂环 | alicyclics |
木脂素 | lignans | 杂环 | heterocycle |
强心试 | cardiac glycoside | 大环内醋 | macrolide |
糖嫦 | terpene | 单宁 | tannin |
倍半菇 | sesquiterpenoid | 酚 | phenol |
二菇 | diterpenoid | 酸 | acid |
三站 | triterpenoid | 苯甲酸 | benzoic acid |
单菇 | monoterpenoid | 凿体 | steroid |
香豆素 | coumarin | 蚩体皂忒 | steroidal saponin |
篇(二米乙烯) | Stilbene | 其他 | other |
同时 CNPD™ 还收集了天然产物相关的各类信息,主要包括:
• 天然产物的二维分子结构及三维分子结构。三维分子结构是利用分子力学方法优化得到的。导出的三维分子结构不仅可以进行针对药物靶标的虚拟筛选,而且可以将三维分子结构与生物活性资料相结合,来探索分子结构和活性间的相互关系。
• 天然产物的名称、分子式、分子量、熔点、旋光度等重要理化性质。
• 天然产物的 CAS 登录号。CAS 登录号可以作为与其它化学信息资源关联的便捷接口。
• 一些天然产物的生物活性信息及其参考文献。包括文献来源、作者、年代等详细信息。
• 天然产物的自然来源及其参考文献。包括文献来源、作者、年代等详细信息。
• 原植物或其同属中药在中国传统医药中的应用。包括中文名,拉丁文名,性味,归经及功用主治等。
CNPD™ 的应用
CNPD™ 可以为从事药物化学、植物化学、有机化学、医药、农药及生物化学等领域的研究人员提供有益的帮助,例如:
• 帮助研究人员系统的了解天然产物分离、提取和鉴定的研究方法。
• 对天然产物的结构及生物活性信息进行定量或定性的分析研究,深入了解某类药物的结构与活性之间的关系,为新药研究提供系统的和有价值的信息。
• 通过虚拟筛选方法筛选天然产物数据库 CNPD™ 也是获得先导化合物或活性化合物的一条有效途径。
• 由于天然产物的结构具有非常好的差异性,因此天然产物数据库中的许多化合物可以作为组合化学库设计的起始结构。
• CNPD™ 首次将天然产物、生物活性数据、原植物来源及中药传统应用融合在一起,并且提供三维结构信息,所以它可以帮助科研人员充分了解中国天然产物资源。
因此,在中国的新药、天然产物及相关领域的研究与开发工作中,CNPD™ 是一个不可多de的好工具。
升级 / 补充
中国科学家在对天然产物及中草药的研究中积累了大量的信息资源。CNPD™ 将通过版本升级来充实和完善数据库,包括新条目的 补充以及条目内容的增加、更新等。最新版的 CNPD™ 中还增加用于虚拟筛选的三维结构数据库,为用户在使用其他的分子模拟和 设计软件系统方面提供更多的方便。
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