人类表达谱芯片 v5 版次的更新是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的人类表达谱基因探针, 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主,相较于 v4.3 版本, 除了提高整体的基因覆盖率外,更完整的覆盖与生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站,方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 "
小鼠表达谱芯片Mouse Expression OneArray 小鼠表达谱芯片 Mouse OneArray® v2 Phalanx "Phalanx平台,小鼠表达谱芯片 v2 保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针, 并依据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的更新, 提供更高基因覆盖率的表达谱芯片。探针设计采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理, 以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术进行芯片生产。 小鼠表达谱芯片 v2 探针内容
探针种类 探针数
基因探针设计数据库: 26,423
- RefSeq release 42
- Ensembl release 59
控制探针数 872
总探针数 27,295
基因探针
小鼠表达谱芯片 v2 版次除了保留 v1 中专一性佳的 MEEBO 探针外, 更参考国际公认之 RefSeq 42 及 Ensembl 59 序列数据库, 设计长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提高整体的基因覆盖率外与提供完整的生理途径反应相关的基因, 并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站, 方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 "
大鼠表达谱芯片Rat Expression OneArray 大鼠表达谱芯片 Rat OneArray® v1 Phalanx "Phalanx平台,大鼠表达谱芯片为全新开发的表达谱芯片产品,与其它表达谱系列产品一样, 采用 “一个基因,一个探针” 的设计原理,以 IMPORT 专利技术针对蛋白质编码基因设计高专一性探针, 根据 RefSeq 42 及 Ensembl 59 数据库进行探针的设计, 提供高基因覆盖率的表达谱芯片,以自主的高速布放技术进行芯片生产。大鼠表达谱芯片 v1 探针内容
探针种类 探针数
基因探针设计数据库: 24,358
- RefSeq release 42
- Ensembl release 59
控制探针数 980
总探针数 25,338
基因探针
大鼠表达谱芯片是参考国际公认之 RefSeq 及 Ensembl 序列数据库, 设计长炼 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容主要以蛋白质编码基因 (protein-coding gene) 为主, 提供高基因覆盖率并且每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站, 方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 "
酵母表达谱芯片Yeast Expression OneArray 酵母菌表达谱芯片 Yeast OneArray® v1 Phalanx "Phalanx平台,酵母菌表达谱芯片 v1 的探针是采用 Operon Yeast Genome Array-Ready Oligo Set (AROS) v1.1 与 Yeast Brown Lab Oligo Extension (YBOX) v1.0 探针组信息所设计, 为长链 70 个碱基寡核酸探针。 酵母菌表达谱芯片 v1 于 2010 年 3 月 正式上市。 探针皆设计在离 3’ 端 750 碱基以内的序列,适合用来进行基因表现的研究。酵母菌表达谱芯片 v1 探针内容
探针种类 探针数
基因探针设计数据库: 6,958
- Operon Yeast Genome Array-Ready Oligo Set (AROS) v1.1 38
- Yeast Brown Lab Oligo Extension (YBOX) v1.0 56
控制探针数 684
总探针数 7,642
基因探针
酵母菌表达谱芯片 v1 是由华联的技术团队与中央研究院所共同合作生产, 探针的设计及收集是参考国际上较普遍使用的 Operon Yeast Genome Array-Ready Oligo Set (AROS) v1.1 与 Yeast Brown Lab Oligo Extension (YBOX) v1.0 的探针组信息, 布放 70 个碱基寡核酸的长链探针。 所有的探针皆分布在离基因 3’ 端 750 碱基以内的序列, 适合用来进行基因表现的研究。 "
水稻表达谱芯片Rice Expression OneArray 水稻表达谱芯片 Rice OneArray® v1 Phalanx "Phalanx平台,华联生技与台湾农委会共同合作开发水稻表达谱芯片。 目前水稻表达谱芯片 v1 的雏型已阶段性完成, 并通过基础的质量验证测试。此雏型芯片的探针设计是参考 RGAP v6.1 与 BGI 2008 基因体数据库, 同时涵盖 Japonica 与 Indica 两个水稻品种的信息。 设计原理采用 “一个基因,一个探针” 的概念,以 IMPORT 专利技术针对具有 GO (Gene Ontology) 信息的基因序列设计高专一性探针, 并以自主的高速布放技术生产,为当前具 GO 信息基因涵盖度最广的表达谱芯片。 水稻表达谱芯片 v1 探针内容
探针种类 探针数
基因探针设计数据库: 21,179
- RGAP v6.1
- BGI 2008
控制探针数 824
总探针数 22,003
基因探针
水稻表达谱芯片 v1 的探针设计, 是华联技术团队参考 RGAP v6.1 与 BGI 2008 基因体数据库进行设计, 以具有 GO 信息的基因序列为主, 藉由经年累积的经验所研发之基因批注运算流程,设计具高度专一性的长链 60 个碱基寡核酸 (sense-strand) 的基因探针, 内容包含 Japonica 与 Indica 两个水稻品种, 每一个探针对其源数据库的目标基因皆具高度专一性,避免非目标基因的杂交影响。
此外,华联专业团队建构 ”华联探针批注搜索引擎” (PASS) 网站,方便使用者查询各探针相对应于 NCBI 及 Ensembl 数据库的详细批注。 "
人microRNA芯片Human microRNA OneArray人类 miRNA 芯片 Human miRNA OneArray® v3 Phalanx "Phalanx平台,人类 miRNA 芯片 v3 延续 v2 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 17.0 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。 基因探针
人类 miRNA 芯片 v3 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 17.0 的序列进行探针设计在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含矩阵校准标记探针、 阳性控制探针及阴性控制探针。
"
小鼠&大鼠microRNA芯片Mouse&Rat microRNA OneArray 小鼠&大鼠 miRNA 芯片 Mouse & Rat miRNA OneArray® v3 Phalanx "Phalanx平台,小鼠&大鼠 miRNA 芯片 v3 延续 v2 的设计原理, 参考 Sanger miRBase 数据库 release 17.0 的序列进行探针设计, 并以自有的高速布放技术进行芯片生产。 基因探针
人类 miRNA 芯片 v3 是参考 Sanger miRBase 数据库 release 17.0 的序列进行探针设计在探针设计的过程,依据各序列的特性,进行严格 Tm 值的把关及调整。 在每一芯片上,每一个 miRNA 序列具有 3 个重复的探针。控制探针
为确保芯片数据质量,华联技术团队经过一连串的测试及验证, 设计一系列的质量控制探针,以监控完整的芯片实验步骤,包含矩阵校准标记探针、 阳性控制探针及阴性控制探针。
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其他物种microRNA芯片Other microRNA OneArray 定制 Phalanx Phalanx平台,miRNA 研究资料正不断的更新及增加, 除了人类与小鼠、大鼠外,对于其他物种的研究也越来越多。为了符合不同研究领域的使用, 除了 miRNAOneArray® 标准规格芯片, 华联也同时提供 SangermiRBase 中其他物种 miRNA 或完全制定的 miRNA 客制芯片及样品检测服务。
人类/小鼠表达谱芯片Phalanx OEM Focus Array (Expression)定制 Phalanx Phalanx平台,表达谱定制芯片
人类SNP6.0芯片SNP芯片Genome-Wide Human SNP Array 6.0 v6.0 Affymetrix Affymetrix平台,SNP6.0芯片含有超过906,600个SNPs以及超过946,000个用于检测拷贝数变异的探针。
人类SNP5.0芯片SNP芯片Genome-Wide Human SNP Array 5.0 v5.0 Affymetrix "Affymetrix平台,
SNP5.0芯片是介于500K芯片和6.0芯片之前的一种中间产品,可以为那些经费有限的研究人员提供一种极有吸引力的选择。这种替代500K芯片组进行全基因组关联研究的单张芯片基因分型产品。除了500,568个SNPs, SNP5.0还含有420,000个用于检测拷贝数变异的探针。
"
测序与重测序高通量测序服务Solexa 测序服务 测序 Illumina "Illumina平台,基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,以最廉价的方式将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。这在人类疾病及动植物育种研究等方面具有重大的指导意义。 GAⅡx新增的长插入片段(2-5kb)试剂与已有的双末端(Paired-end)短插入片段相结合,使得深入分析参考系列以外的基因组插入和结构变异成为可能。
技术路线:
样品要求:
⑴客户需要提供可以证明所提供DNA完整性和准确浓度的包括DNA检测的胶图, 紫外分光光度计(nanodrop)检测结果,或者Aglient 2100 Bio-Analyzer的检测结果中一种或多种形式的样品分析结果;
⑵样品纯度:OD值应在1.8~2.0 之间;
⑶样品浓度:样品的浓度越高越好,最低不应低于30ng/μl;样品的量:每次样品制备需要10ug样品;
⑷ DNA如果用乙醇沉淀,则可以常温运输;否则用干冰运输,时间不要超过72小时;如果利用冰袋运输,时间不要超过24小时;且在运输过程中务必将管口密封好。
宏基因组测序
宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的最前沿领域。
"
表达谱分析高通量测序服务Solexa 测序服务 表达谱,转录 Illumina "Illumina平台,基因组De novo测序
llumina Genome AnalyzerⅡx系统作为当今世界上最先进、最经济的平台既可进行整个基因组序列测定也可进行基因组上一个大片断候选区域的序列测定。Solexa的芯片杂交技术与可逆中止化合物染料(reversible terminator chemistry)测序技术使之成为新一代测序技术中应用最为广泛的技术平台。
对于细菌、真菌等基因组测序,Solexa高通量测序技术和Solexa Paired-End技术使得基因组测序成本及基因组组装难度均大大降低,缩短了测序时间,用传统测序法1/5的费用和1/3的时间即可得到更高精度和覆盖倍数的基因组精细图,生物信息学分析也更加完善。
技术路线:
样品要求:
⑴样品纯度要求: OD值应在1.8至2.0之间;电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。
⑵样品浓度:浓度不低于200ng/ul;样品总量不低于10ug。
⑶请提供DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
全基因组重测序
基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,以最廉价的方式将单个参考基因组信息扩增为生物群体的遗传特征。这在人类疾病及动植物育种研究等方面具有重大的指导意义。 GAⅡx新增的长插入片段(2-5kb)试剂与已有的双末端(Paired-end)短插入片段相结合,使得深入分析参考系列以外的基因组插入和结构变异成为可能。
技术路线:
样品要求:
⑴客户需要提供可以证明所提供DNA完整性和准确浓度的包括DNA检测的胶图, 紫外分光光度计(nanodrop)检测结果,或者Aglient 2100 Bio-Analyzer的检测结果中一种或多种形式的样品分析结果;
⑵样品纯度:OD值应在1.8~2.0 之间;
⑶样品浓度:样品的浓度越高越好,最低不应低于30ng/μl;样品的量:每次样品制备需要10ug样品;
⑷ DNA如果用乙醇沉淀,则可以常温运输;否则用干冰运输,时间不要超过72小时;如果利用冰袋运输,时间不要超过24小时;且在运输过程中务必将管口密封好。
宏基因组测序
宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成为微生物研究的最前沿领域。
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CGH、exon分析高通量测序服务Solexa 测序服务 CGH Illumina Illumina平台,CGH、EXON分析
microRNA测序 高通量测序服务Solexa 测序服务 microRNA Illumina "Illumina平台, Solexa测序技术可以提供一套全新独特的,适用于各个物种的小RNA深度鉴定与定量分析的研究平台。通过大量的平行测序,可以发掘、鉴定并定量出任何物种全基因组水平的小RNA图谱,可以更深入的研究其功能。应用这种低成本快速测定数百万标签序列的新方法,Illumina Genome AnalyzerⅡx提供了解密小RNA图谱独一无二的方法。
技术路线:
样品要求:
⑴样品纯度要求: OD值应在1.8至2.2之间;电泳检测28S:18S至少大于1.5。
⑵样品浓度: total RNA浓度不低于750ng/ul;样品总量不低于40ug(Small RNA: total RNA大于0.3%)。或提供浓度大于2ng/ul,总量大于180ng的Small RNA样品。
⑶请提供Small RNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。
"
人类外显子芯片其他类型芯片GeneChip Human Exon 1.0ST Array Exon Affymetrix Affymetrix平台,人类全转录本表达谱芯片,约有 4 个探针来针对每个外显子 / 约有 40 个探针来针对每个基因,覆盖经验性及预测的外显子序列,约 1000000 个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
小鼠外显子芯片其他类型芯片GeneChip Mouse Exon 1.0ST Array Exon Affymetrix Affymetrix平台,小鼠全转录本表达谱芯片,约有 4 个探针来针对每个外显子 / 约有 40 个探针来针对每个基因,覆盖经验性及预测的外显子序列,约 1000000 个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
大鼠外显子芯片其他类型芯片GeneChip Rat Exon 1.0ST Array Exon Affymetrix Affymetrix平台,大鼠全转录本表达谱芯片,约有 4 个探针来针对每个外显子 / 约有 40 个探针来针对每个基因,覆盖经验性及预测的外显子序列,约 850000 个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
Human Gene其他类型芯片GeneChip® Human Gene 1.0 ST Array Human Gene Affymetrix Affymetrix平台,是最新的Affymetrix表达谱芯片产品,该芯片涵盖了所有基因的转录本,代表了28,869明晰的基因。此芯片的设计是基于2006年3月(UCSC hg18,NCBI Build 36)人类基因组序列和RefSeq, Ensembl 以及假定的全 CDS GenBank转录本完成的。服务包括芯片的检测和原始数据基本生物信息学分析。
Tilling其他类型芯片GeneChip Human Tiling Arrays Tilling Affymetrix Affymetrix平台, 是用于精确定位蛋白质/DNA相互作用位点和发现新转录本的最高级的解决方案。随着全基因组测序的完成,使更多形式的基因组范围的实验成为可能。Tiling Arrays提供了一种实际的基因组读出器,研究者不仅可以实现上述在ChIP实验中定位蛋白质/DNA相互作用以及发现RNA新转录本的功能; 而且可以解读如甲基化、乙酰化等表观基因组学变化
牛全基因组分型芯片SNP芯片BovineSNP50 Genotyping BeadChip SNP 50 Illumina "Illumina平台,
Illumina 公司与牛类研究专家联合开发出牛 SNP50 基因芯片,该芯片含超过 54 , 000 个靶 SNP 探针, SNP 信息来自 Illumina Genome Analzyer 测序结果和已发布的公共信息。该芯片可分析 12 个样本,是分析牛基因变异的经济有效的实验手段。牛 SNP50 基因芯片 SNP 位点的平均间隔为 51.5kb ,相较于全基因组扫描,鉴定数量性状位点,比较遗传学等其他试验方法,该方法的探针密度更高,分析更有效"
犬全基因组分型芯片SNP芯片CanineSNP20 Genotyping BeadChip SNP 20 Illumina Illumina平台,犬 SNP20 基因芯片中含有大量信息的 SNP 探针,平均间隔为 22362 ,可以对任何一种家养犬类进行全基因组扫描。 Illumina 公司通过与 CanFam2.0 合作,挑选出高多态性位点以鉴定不同的家养犬类种群。如果 SNP 平均密度为每兆 8 个位点,那么该芯片可包含所有的种群关联研究位点。该芯片可同时检验 12 个样本,大大节约了经费。采用 BeadArray 技术设计,及无 PCR 步骤的 Infinium 方法分析。芯片具有极好的基因覆盖率、 call rate 值和重复率
马全基因组 SNP 分型芯片SNP芯片EquineSNP50 Genotyping BeadChip SNP 50 Illumina Illumina平台,该芯片含 54 , 602 个 SNP 位点,这些位点均一分布在 15 个品种马匹的全基因组序列上。芯片数据信息来自马基因组测序计划。马 SNP50 基因芯片 SNP 的平均间隔为 43.2kb 。该基因芯片可同时检测 12 个样本,为各种全基因组研究提供了可能,例如基因关联研究和鉴定数量性状位点的研究
猪全基因组 SNP 分型芯片SNP芯片PorcineSNP60 Genotyping BeadChip SNP 60 Illumina Illumina平台,猪 SNP60 基因分型芯片是通过 Illumina 的 iSelect 项目与国际领先研究协会合作开发。它包含超过 60000 个 SNP 位点,以步长平均每 40kb 有一个标记,覆盖猪的基因组。此 12 样本芯片整合了多种猪的基因差异,包括杜洛克猪,长白猪,皮特兰猪和大白猪,其性价比高,能提供足够的 SNP 密度,可应用与全基因组关联研究或其他研究中,如:全基因组选择、测定遗传指数、鉴定数量性状位点、比较基因研究
羊全基因组 SNP 分型芯片SNP芯片OvineSNP50 Genotyping BeadChip SNP 50 Illumina Illumina平台,羊 SNP50 基因分型芯片是通过 Illumina 的 iSelect 项目与国际羊基因组协会合作开发。它包含超过 50000 个 SNP 位点,平均每 46kb 有一个标记,覆盖整个基因组。此 12 样本芯片整合了多个羊品种基因差异,性价比高,能提供足够的 SNP 密度,可应用与全基因组关联研究或其他研究中
人550SNPSNP芯片HumanHap 550+ 550+ Illumina Illumina平台,在包含 HumanHap 550 相同内容的基础上,研究人员可根据自己的需要加入最多 120600 个 SNPs
人510S SNPSNP芯片Human Exon 510S-Duo 510s Illumina "Illumina平台,
包含了约 510000 个标签 SNP 。其中 330000 个标签 SNP 偏重于基因中央的 SNPs 和 nsSNPs ,其他一些有研究价值的标签 SNP 主要针对于新近报导的 CNV 区域,与药物代谢有关的基因区域和 MHC 区域。同样可以在一张芯片上平行进行 2 个样本的检测,是 HumanHap 550-Duo 的辅助产品,将这两款产品联合使用则能提供相当于 Human 1M 的全部 SNP 信息。 "
人660SNPSNP芯片Human660W-Quad 660 Illumina Illumina平台,在一张芯片上可平行进行 4 个样品的检测,显著的增加了样本输出信息量,减少了实验操作中的误差。该芯片广泛地采用了 HumanHap550 芯片的内容,以及额外增加了 100,000 个遗传标记。 Human 660w-quad 涵盖的全基因组信息,对于已知的和新近报道的 CNV 区域来说都具有权威性。 Human 660w-quad 上的 SNPs 以约 5kb 的密度均匀分布在基因组上。针对于基因组中高多态性的 CNV 区域(片段复制区和无 SNP 的基因组区域), Human 660w-quad 设计了一些特异的靶标来进行研究
"肿瘤相关 SNP 芯片SNP芯片Cancer Panel
" cancer Illumina Illumina平台,选择约 400 个肿瘤相关基因的 >1400 个 SNP 标记,信息来源于美国 NIHSNP500 肿瘤数据库 http://snp500cancer.nci.nih.gov/ 。
"12样本SNPSNP芯片HumanNS-12:
" 12 Illumina Illumina平台,在一张芯片可平行做 12 个样品,每个样品可检测 13,900 个非同义 SNP 。
自定义 SNP 芯片SNP芯片iSelect 定制 Illumina "Illumina平台,
完全根据研究需要挑选 SNP 位点进行研究。每张芯片可平行做 12 个样品,每个样品可检测 7,600 - 60,800 个 SNP 位点"
"
主要组织兼容性研究芯片SNP芯片MHC Panel" MHC Illumina Illumina平台,MHC(Major Histocompatibility Complex) 主要组织相容性区域是一段 4Mb 的基因组序列,位于 Chr 6p21 上,包含了 160 个基因。这些基因中有 40% 与免疫蛋白编码相关,其中也包括了白细胞抗原基因等。 MHC 芯片针对这一区域挑选了 2,400 个平均间隔 2kb 的 SNP 标记,对该区域的 SNP 进行检测。 MHC 芯片可广泛应用于免疫,移植,疾病等相关研究
小鼠全基因组表达谱芯片表达谱芯片MouseWG-6 Beadchip 6 Illumina "Illumina平台,Illumina 全基因组表达芯片是利用独特的微珠阵列BeadArrayTM技术生产的,具有非常高的灵敏度、精确性和信息含量,并大幅度降低了成本。
特点
■高密度:每平方厘米面积上可有约400万个点(微珠)。
■低上样量:每个芯片在一轮反转录(IVT)的情况下仅需50-100ngRNA。
■高重复性:其设计采取了“无序自组装”方式,每种类型微珠30倍重复,“片中片”的设计特点保证了它的高重复性。
■高特异性探针:通过生物信息学分析,针对每个基因设计2-3个候选探针,这些探针被用来和26种不同组织样本进行杂交实验,所得数据通过专利算法分析后选择特异性和反应性能最好的唯一探针制成芯片。这种设计充分保证了其特异性及高灵敏度。
■实验过程全程监控:芯片设计了几百个内参微珠对实验进行监控,包括:样品质量、标记反应成功率、杂交严谨性、信号产生。
■高均一性:芯片采取了微珠和光纤的设计,芯片点(微珠)大小、点与点之间间距完全均一。
■芯片生产100%QC质控:利用生产过程中专利的解码技术,质控可深入到每张芯片每个微珠上,保证了数据的可靠性
和重复性。芯片信息:每张芯片可平行检测6个样本,包含有约45,281个包含MEMBO-RefSeq及RefSeq及其补充序列,RIKEN补充序列的转录本信息。
应用范围:通过模式生物基因表达谱的研究,了解疾病,阐述生命现象进行肿瘤机制研究,寻找抗癌药物作用靶点,肿瘤早期诊断,预防;研究细胞的发育,分化,凋亡,信号转导网络;药物筛选,寻找药物靶点,作用机制,毒理研究。"
"人类全基因组表达谱芯片表达谱芯片Human-12T Beadchip
" 12 Illumina "Illumina平台,基因表达谱芯片可使是科研工作者实现在mRNA水平上同时平行研究成百上千乃至上万条基因的表达关系。 它与传统的研究基因表达的方法(如差异cDNA文库筛选、Northern blot和PCR)相比较,可为使用者节省大量的研究经费和时间并获得范围更广、更具有关联性的研究结果。它的主要用途是用于大规模分析一定的生物对象在特定生物过程中(如疾病、发育、分化、凋亡等)基因表达变化的全面信息。目前已经广泛应用于基因表达检测、基因功能研究、新基因识别、药物靶点筛选、药物作用机理和毒理、疾病相关基因和生物标记物等众多研究领域。
芯片信息:每张可平行检测12个样本,包含含有共约48,804个基因转录本,信息来源除36,000个NCBI RefSeq外,还包含了从UniGene的12,000个转录本信息。 "
人 450K甲基化芯片甲基化芯片Human 450K Beadchip 45K Illumina Illumina平台,每张芯片平行检测12 样本,包含45万个CpG位点。芯片检出率/重复性达98%以上。
定制甲基化芯片甲基化芯片 定制 Illumina Illumina平台,针对客户的研究需要提供96或者384个CpG位点进行探针的设计,芯片的定制。
NimbelGen多物种全基因组表达谱芯片检测表达谱芯片 NimbelGen "NimbleGen芯片产品具有高密度、长探针和芯片设计灵活的特点,表达谱芯片具有多方面优势:
1 芯片具有高密度探针容量:NimbleGen芯片具有超高密度容量,这意味着对每个基因的转录本可以独立设计多个探针。每个基因的多个探针采取平均信号值方式整合数据,增加了统计学可靠性,降低了单一探针表现不稳定带来的风险。探针高密度容量也可以转化为每张芯片的样本检测通量,在每张芯片上检测更多样本。
2 长寡核苷酸探针:长探针设计(45-60mer)有效提高了信噪比、灵敏度和特异性,从而增加分析的准确性。目前通常设计的探针长度为:真核60mer;原核45-60mer。
3 多种芯片格式,可以实现多个样本通量检测:目前Roche NimbleGen表达谱芯片格式有385K、 4x72K、12x135K等多种芯片格式,可以独立杂交1个到12个样本,有效降低芯片成本。
4 丰富的芯片产品线:现有针对多个真核生物物种的全基因组表达谱芯片,在微生物物种的检测方面,更具有300多种微生物表达谱芯片,是目前微生物芯片产品线最完善的分析平台。
5 产品更新快,定制灵活性强:采用无掩模的芯片生产方式,可最大限度地根据数据库版本或客户指定序列灵活制备芯片,满足客户多方面需求。
6 单通道检测,无需扩增的标记方法:单通道检测在实验设计方面比双通道芯片更加简明,但在检测准确性和对批次影响的控制方面有所牺牲;无需体外扩增的标记方法,降低了检测成本,但在发现差异表达基因方面也有所牺牲,而且与扩增方法相比,所需的RNA起始检测量相对多一些。"
弧菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 弧菌表达谱芯片NimbelGen平台
支原体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 支原体表达谱芯片NimbelGen平台
稻瘟菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 稻瘟菌表达谱芯片NimbelGen平台
肠球菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 肠球菌表达谱芯片NimbelGen平台
乳酸菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 乳酸菌表达谱芯片NimbelGen平台
梭菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 梭菌属表达谱芯片NimbelGen平台
衣原体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 衣原体表达谱芯片NimbelGen平台
螺杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 螺杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
梭菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 梭菌属表达谱芯片NimbelGen平台
细螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 细螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台
单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台
地杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 地杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
发光细菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 发光细菌表达谱芯片NimbelGen平台
链球菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 链球菌属表达谱芯片NimbelGen平台
硫化叶菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 硫化叶菌表达谱芯片NimbelGen平台
绿硫细菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 绿硫细菌表达谱芯片NimbelGen平台
农杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 农杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
布鲁氏菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 布鲁氏菌表达谱芯片NimbelGen平台
超嗜热菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 超嗜热菌表达谱芯片NimbelGen平台
大肠肝菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 大肠肝菌表达谱芯片NimbelGen平台
绿脓杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 绿脓杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
丙酸菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 丙酸菌属表达谱芯片NimbelGen平台
聚球藻属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 聚球藻属表达谱芯片NimbelGen平台
脲原体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 脲原体属表达谱芯片NimbelGen平台
拟杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 拟杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
军团菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 军团菌属表达谱芯片NimbelGen平台
蛭弧菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 蛭弧菌属表达谱芯片NimbelGen平台
欧文菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 欧文菌属表达谱芯片NimbelGen平台
葡萄球菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 葡萄球菌表达谱芯片NimbelGen平台
热球菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 热球菌属表达谱芯片NimbelGen平台
炭疽杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 炭疽杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
沙门氏菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 沙门氏菌表达谱芯片NimbelGen平台
嗜血菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 嗜血菌属表达谱芯片NimbelGen平台
嗜衣体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 嗜衣体属表达谱芯片NimbelGen平台
双歧杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 双歧杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
暗网菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 暗网菌属表达谱芯片NimbelGen平台
鱼腥藻属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 鱼腥藻属表达谱芯片NimbelGen平台
沃廉菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 沃廉菌属表达谱芯片NimbelGen平台
海栖热袍菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 海栖热袍菌表达谱芯片NimbelGen平台
红孢子虫属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 红孢子虫属表达谱芯片NimbelGen平台
不动杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 不动杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
梅毒螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 梅毒螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台
奈瑟嗜菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 奈瑟嗜菌属表达谱芯片NimbelGen平台
棒状杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 棒状杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
苛养木杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 苛养木杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
酒类酒球属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 酒类酒球属表达谱芯片NimbelGen平台
巴斯德菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 巴斯德菌属表达谱芯片NimbelGen平台
假单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 假单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台
李斯特菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 李斯特菌属表达谱芯片NimbelGen平台
立克次氏体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 立克次氏体表达谱芯片NimbelGen平台
弗氏志贺菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 弗氏志贺菌表达谱芯片NimbelGen平台
热源体菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 热源体菌属表达谱芯片NimbelGen平台
耶尔森氏菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 耶尔森氏菌表达谱芯片NimbelGen平台
埃立克体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 埃立克体属表达谱芯片NimbelGen平台
原绿球藻属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 原绿球藻属表达谱芯片NimbelGen平台
幽门螺杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 幽门螺杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
芽孢杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 芽孢杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
螺旋体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 螺旋体属表达谱芯片NimbelGen平台
密螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 密螺旋体表达谱芯片NimbelGen平台
念珠藻属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 念珠藻属表达谱芯片NimbelGen平台
弯曲杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 弯曲杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
敏捷热气菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 敏捷热气菌表达谱芯片NimbelGen平台
蜡样芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 蜡样芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
蚜虫内共生菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 蚜虫内共生菌表达谱芯片NimbelGen平台
亚消化螺菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 亚消化螺菌属表达谱芯片NimbelGen平台
亚消化球菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 亚消化球菌属表达谱芯片NimbelGen平台
产甲烷球菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 产甲烷球菌属表达谱芯片NimbelGen平台
发酵单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 发酵单胞菌属表达谱芯片NimbelGen平台
巴尔通氏体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 巴尔通氏体属表达谱芯片NimbelGen平台
枯草芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 枯草芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
弗朗西斯氏菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 弗朗西斯氏菌属表达谱芯片NimbelGen平台
甲烷八叠球菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 甲烷八叠球菌属表达谱芯片NimbelGen平台
克劳氏芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 克劳氏芽孢杆菌表达谱芯片NimbelGen平台
克雷白氏杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 克雷白氏杆菌属表达谱芯片NimbelGen平台
沃尔巴克氏体属表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 沃尔巴克氏体属表达谱芯片NimbelGen平台
伯纳特氏立克次氏体表达谱芯片NimbelGen平台 NimbelGen 伯纳特氏立克次氏体表达谱芯片NimbelGen平台
多物种染色质免疫共沉淀芯片NimbleGen ChIP-on-chip NimbelGen "高密度探针,高分辨率检测:利用多达2.1M探针以高分辨率叠瓦式覆盖全基因组或特定染色体(标准的100bp间距),精确绘制基因组范围内蛋白质结合位点,组蛋白修饰位点或染色质结构变化。对于某些模式生物,一张2.1M芯片可以更高密度覆盖全部基因组,例如果蝇(D. melanogaster)55bp探针间隔;线虫(C. elegans)40bp探针间隔。还可以根据客户需要自定义芯片设计,以更高分辨率实现基因组覆盖。
高灵敏度和特异性:通过长度在50-75mer探针Tm值优化设计,具有极高灵敏度和特异性;双通道杂交可以有效消减芯片间的变异,提高了芯片重复性,能够检测免疫沉淀样本中富集度低至1.25倍到2倍的结合位点。
多样化的芯片设计:覆盖人,小鼠,大鼠,鸡,狗,蚯蚓,果蝇和部分植物的全基因组芯片;针对人和小鼠生物学上重要的基因组区域,提供针对启动子和/或CpG岛的甲基化芯片;或者根据客户设计的探针来定制芯片。"
多物种甲基化芯片NimbleGen DNA NimbelGen "罗氏NimbleGen提供全基因组甲基化检测芯片、启动子甲基化芯片和定制的甲基化芯片。在检测上采用甲基化DNA免疫沉淀方法(Methylated DNA Immunoprecipitation, MeDIP),即使用甲基化胞嘧啶特异的抗体对甲基化DNA进行富集后,进行标记和杂交,该过程操作简便,可靠性高。罗氏NimbleGen丰富而多样化的产品为基础生物学以及肿瘤和其他疾病的表现遗传学机制研究,直至寻找大规模的甲基化表观遗传学标志物提供了高效的技术平台,技术特点
高密度探针,高分辨率检测:针对人、大鼠和小鼠三个物种设计的2.1M全基因组叠瓦式芯片(Whole Gemone Tiling),使用10张2.1M芯片,以100bp的间隔(或者4张芯片以200bp左右的间隔)便实现全部非重复区基因组覆盖;仅以1张针对人和小鼠已知基因启动子的2.1M Deluxe启动子芯片,单张芯片便能以100bp的探针间隔覆盖人或小鼠已注释的启动子、已注释的CpG岛、miRNA基因启动子、或人为选择的编码区基因;定制芯片可以在更高分辨率下实现对基因组覆盖。
高灵敏度和高特异性:通过对长度在50-75mer探针Tm值的优化设计,具有极高灵敏度和特异性;双通道杂交可以有效消减芯片间的差异,提高芯片重复性,能够可靠地检测出每500bp片段内2个甲基化CpG。CpG与增强子芯片包含印记基因(如H19/IGF2)和深度甲基化的HoxA基因群,可以作为阳性对照区监控实验结果。
覆盖多个物种的芯片,多种芯片规格:覆盖人,小鼠,大鼠,鸡,狗,蚯蚓,果蝇和部分植物的全基因组芯片;针对人和小鼠生物学上重要的基因组区域,提供针对启动子和/或CpG岛的甲基化芯片;或者根据客户设计的探针来定制芯片。
最新的芯片设计:使用最新的基因组和序列注释信息,确保全面而及时的基因组信息更新。也可以根据原本的基因组数据获取芯片设计,方便与原来的研究结果进行对比。"
多物种CGH芯片NimbleGen aCGH NimbelGen "采用无膜芯片合成技术,可以合成长达85个碱基的寡核苷酸片段,在一张标准大小的芯片上可以合成高达210万个寡核苷酸探针。其芯片生产具有三个特点,即长寡核苷酸探针(可达85mer)、超高密度和完全灵活性设计。罗氏NimbleGen在aCGH平台方面推出了多个物种检测芯片,是目前CGH产品线最完善的分析平台。既有针对多个物种全基因组DNA拷贝数变异进行检测的芯片,也有针对人类某几个染色体进行分析的芯片;还可针对客户感兴趣的染色体或基因组区域灵活设计芯片。
仅一张罗氏NimbleGen根据人类基因组序列信息设计的2.1M超高密度CGH芯片,就可以在1.1Kb分辨率下完成全基因组检测,可有效检测人基因组中低至约5kb大小的拷贝数变异。该芯片探针覆盖基因和基因间区域,并经过优化,增加了基因组低拷贝重复区段的探针覆盖率。此外罗氏NimbleGen还有多种针对人类特定染色体或外显子的CGH芯片,以及多物种CGH芯片满足研究者多方面需求。芯片兼备高密度和长探针优势:单张芯片探针密度最高可达2.1M,高分辨率有利于发现更微小的拷贝数变化;探针长度高达85mer,有利于提高探针信号强度和灵敏度;探针长度可变有利于Tm值优化,保证杂交结果稳定性。
多种芯片格式,可以实现多个样本通量检测:目前罗氏NimbleGen芯片有12x135K、3x720K、2.1M、 4x72K等多种芯片格式,可以独立杂交1至12个样本,有效降低芯片成本。
丰富的芯片产品线:现有针对多个物种全基因组CGH分析的目录芯片,是目前市面CGH产品最完善的分析平台。
定制灵活性强:采用无膜的芯片生产方式,可最大限度地根据客户指定序列或数据库版本灵活制备芯片,满足客户多方面需求。"
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