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Ni系列显微镜有两种机型：Ni-E :可自动切换观察方法和调节显微镜配件的电动机型，Ni-U: 具有部分电动选项的手动机型。
Ni系列显微镜具有三个特点：
1. 可分两层启用光学路径的分层结构所带来的系统扩展性：在加装双层荧光装置和光活化装置后，可以进行需要使用Kaede和PA-GFP等激光蛋白和荧光蛋白的应用。
2．Plan Apochromat λ系列物镜所代表的优越光学性能：Plan Apochromat λ系列物镜具有NA超大、长波长范围内透过率大大提高、色差矫正横跨435-850nm等优点，这些透镜可以在任何波长下获取明亮清晰的图像用于近红外成像和多色荧光成像。由于即使在激发光线微弱时也可以拍摄到明亮的图像，所以对标本的损坏可以降到很小。
3．多种高速电动配件：电动激发阻挡滤光片转轮和电动光闸的速度更高，可以快速改变波长，从而减轻样本的光褪色程度。
Ci系列临床和检验显微镜简化了放大倍率切换、光线强度重现和图像拍摄等设定操作。底座小巧，节约了占用的观察空间。主要有三种机型：Ci-E 配有LED照明的电动机型， Ci-L配有LED照明的手动机型，Ci-S配有卤素灯照明的手动机型。绿色环保、人体工学、简单易用
很多情况下显微镜观察都必不可少。研究人员需要快速准确地完成任务，同时长时间保持专注。
尼康ECLIPSE Ci-L plus正置显微镜的设计在重视易用性的同时，也注重了研究人员的健康和工作方式。
长时间使用也不易引起眼睛疲劳
尼康开发的光强度管理 (LIM) 功能会自动存储亮度设置的任何变化。这有助于避免观察过程中在不同放大倍率之间切换时亮度发生剧烈变化，从而有助于减轻眼睛疲劳
观察时可保持自然姿态
注重消除颈部，肩部及背部压力，符合人体工学的设计
通过自动亮度调节保持不变的观察姿态
LIM功能可保存并调出每个物镜的理想亮度级别，无需在每次切换物镜时手动调整光源和改变姿态。
用户友好的载物台操作
在观察过程中体验更有效率的乐趣
一目了然的状态显示，便于轻松确认
在转动物镜转盘时自动调节标尺
电脑显示屏上的标尺会自动更改以匹配放大倍率，无需手动设置标尺。
明亮均匀的环保照明
Eco-illumination 是一种低功耗、环保的照明系统。其60,000小时的高亮度LED可以产生均匀的亮度，并降低灯泡更换的成本和工作量。通过组合准直透镜、复眼光学器件和LED照明，即使在高倍率下也可以获得明亮和边缘到边缘的均匀图像。LED照明器具有低发热量，并在每次放大时提供相同的色温。
轻松捕捉图像
在观察期间，只需单击显微镜底座上的图像捕获按钮，Digital Sight相机即可捕获标本图像。DS-L4相机控制单元触摸屏上的观察技术图标为每种观察方法提供了理想的相机设置。此外，ECLIPSE Ci系列显微镜可通过DS-L4连接到远程PC，以实现远程查看，在线教育和远程协作。
还有多种观察方式：相差、简易偏光、灵敏的彩色偏光、暗场、落射荧光...
Ei教学显微镜ECLIPSE Ei带复眼系统的LED照明保证亮度的均匀；“载物台限上位设定”功能，保护样本和物镜；可提供双目，三目镜筒选择；视场数20mm；在线指南提供使用说明，动画演示。
Si临床及教学用显微镜ECLIPSE Si 带复眼系统的LED照明保证亮度的均匀；L.I.M光强管理自动记忆并再现每个物镜的光强度；ECO模式下显微镜如果一段时间没有任何操作，显微镜将自动关闭照明；多种观察方式：明场，相差，暗场，简易偏光，透射荧光；在线指南提供使用说明，动画演示。
手机版：NIKON正置显微镜系列
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