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NEXTflex® Rapid DNA-Seq Library Prep Kit
Bioo Scientific 公司的NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit兼容于Illumina 测序平台的测序建库，样品DNA起始量可少至1ng，整个建库流程仅用2 小时或更短的时间。此试剂盒适用于基因组DNA、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本、ChIP DNA和低起始量的临床样本的建库。NEXTflex Rapid DNA-Seq Kit 样品的起始量范围非常灵活，跨越了3个数量级，从1ng 至1ug 。这是一个基于磁珠纯化、无需电泳进行片段选择的实验方案，多达384种接头可有效运用于多重测序NEXTflex Rapid DNA-Seq Kit与“Enhanced Adapter Ligation Technology ”联合使用，可以有效的连接更长的接头，得到更长的、种类更多的测reads。Bioo Scientific 公司的连接酶与聚合酶预混液可以确保建库过程的高质量进行。
NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 建库结果
A．NEXTflex® Rapid DNA-Seq kit (左)和竞争品牌N’s kit (右)的建库后片段大小覆盖率比较。（实验所用样品相同，每个样品进行3次重复实验，所有样品的纯化和片段选择全部使用AMPureXP beads，数据皆用Agilent 2100分析软件进行分析。）
B．NEXTflex® Rapid DNA-Seq kit和竞争品牌N’s kit连接率的直接比较。图中红色部
分表示的未连接的产物比例；黄色，代表单端连接比例；绿色，代表双端连接比
例。
什么是“Enhanced Ligation Adapter Technology ”
这个试剂盒的特色“Enhanced Ligation Adapter Technology”可在建库时生成大量的不同的测序reads。NEXTflex连接酶混合液的优势在于连接步骤中可连接更长的接头并可达到更好的连接效率。连接酶与传统的T4 DNA 连接酶相比，可以更高效率的(>10 9 ，传统酶的效率为10 6 )修复 DNA缺口，Bioo Scientific 公司已经在建库的接头连接方面取得了革命性的进展。“Enhanced Adapter Ligation Technology”减少接头二聚体和增加双端接头连接效率。用NEXTflex 连接酶混合液，使用者可得到更多不同reads、更丰富的测序多样性和更高的测序覆盖率。
多重测序
NEXTflex®接头较长，包含index序列，改进了多重建库实验流程，样本起始量也可进行灵活的选择。这些接头可用于单端测序、双端测序和多重测序。NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 与NEXTflex® DNA Barcodes、NEXTflex-96® DNA Barcodes 和NEXTflex® Dual-Indexed Barcodes搭配用于10 ng或更多的起始材料的建库，也与NEXTflex® ChIP-Seq Barcodes 和NEXTflex-96® ChIP-Seq Barcodes搭配用于少于10ng的起始材料的建库。
产品列表：
NEXTFLEX® RAPID DNA-SEQ KIT 2.0
PerkinElmer®优化出一款DNA建库试剂盒NEXTFLEX® rapid DNA-seq kit 2.0 ,该试剂盒以片段化基因组DNA为样本，可得到高质量、高产量的DNA测序文库，试剂盒包含文库制备试剂，接头和纯化磁珠。实验室可选择使用NEXTFLEX-HT™ barcodes进行384种样本的多重测序建库，或使用NEXTFLEX® unique dual index barcodes进行192种样本的多重测序建库。
主要特点：
NEXTflex™ ChIP-Seq Kit是为极低起始量的样本进行建库而设计的一款文库制备试剂盒，样本起始量低至1ng的ChIP DNA或genomic DNA ，兼容于Illumina 测序平台。
NEXTflex ChIP-Seq Kit使用BIOO专利Enhanced Adapter Ligation Technology，并以最少的样本起始量得到较高的文库产量。连接酶预混液的功效进一步提升，用户可有效的连接更长的接头，获得更好的连接效果。NEXTflexChIP-Seq Kit采用酶预混试剂和磁珠纯化法，简化了整个实验流程，减少移液步骤和建库消耗的时间。
NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes与Enhanced Adapter Ligation Technology搭配使用，用户可同时处理96种样本，提供一种超强的ChIP测序能力。
NEXTflex™ Bisulfite-Seq Kit可用于简化的表观亚硫酸氢盐测序（RRBS）和全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）文库制备，且适用于Illumina 测序平台上的单端测序、双端测序和多重测序建库。试剂盒中包含NEXTflex™ U+ Polymerase Mix，可以识别出DNA模板中存在的尿嘧啶，并扩增重亚硫酸盐覆盖的模板。
NEXTflex™ Bisulfite-Seq Kit可使用NEXTflex™ Msp1限制性内切酶达到简化表观测序的目的，Msp1限制性内切酶可以单独购买，用于选择富集CpG 区域，从而达到更高的测序深度。NEXTflex Bisulfite-Seq Kit也可不使用Msp1限制性内切酶来进行全基因组甲基化测序分析，包括检测不能在RRBS方法中被富集的CpG 区域。
NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit包含最初的NEXTflex™ DNA Sequencing Kit的所有优点和特别设计的master-mixed enzymes，NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit完全不需要PCR扩增。扩增AT或GC丰富的基因区域时会引起核苷酸组成序列偏差，并对分析过程造成严重的障碍。使用特别设计
的master-mixed enzymes，NEXTflex PCR-Free DNA Sequencing Kit完全省去了对扩增的需求，能够得到更好的read覆盖率、减少接头二聚体，可降低测序成本和测序偏差，得到更好的短序列组装效果。在评估偏差时，低质量和高GC reads的存在，导致序列不能与参考基因组保持一致。序列高GC含量会导致GC含量随PCR继续提高，这表示基础性表达较差。本试剂盒消除对PCR需求，以消除偏差，获得更多代表性reads。同时，PCR也是引起基因重复的一个重要原因，这样会增加测序成本、接头二聚体和在簇检测中的阻碍。使用NEXTflex PCR-Free Kit试剂盒，用户能够减少重复序列数量，确保得到更良好的reads匹配数。
NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit兼容于Illumina 测序平台的测序建库，起始样本量可低至1ng循环肿瘤DNA(ctDNA) 或游离胎儿DNA (cffDNA)。常见的应用包括：利用液体活检进行循环肿瘤细胞（ctDNA）测序和对游离胎儿DNA（cffDNA）测序。
NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq kit构建的文库具有高产量、高覆盖率、低重复率和低GC偏差的优点，适用于Illumina®测序平台。该试剂盒将酶片段化步骤与一个可重复、理想化的单管方案相结合。试剂盒包含酶片段化试剂、文库构建试剂和纯化/片段选择磁珠，整个试剂盒性能已进行优化，确保了高质量文库的构建。NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq文库构建试剂盒可与NEXTFLEX® barcodes搭配使用，提供一个灵活的解决方案。NEXTFLEX®barcodes颜色平衡（color-balanced）且经过专利QC纯度检测，确保测序结果的准确性。
关于NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 的部分引用文献
- 样品DNA起始量可以在1 ng-1 ug 间灵活选择
- 2小时或者更短时间完成整个实验流程，减少人工操作时间
- 接头连接效率高
- 减少建库偏差
- 可进行自动化建库
- 灵活的接头方案供选择—多达384种接头用于多重测序
- 经Illumina 测序平台验证
- 可用于单端测序、双端测序和多重基因组DNA测序建库
- 匹配PerkinElmer Sciclone 和 NGSx 以及 Biomek® FX 和Biomek® FXP Laboratory 自动化系统
Bioo Scientific 公司的NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit兼容于Illumina 测序平台的测序建库，样品DNA起始量可少至1ng，整个建库流程仅用2 小时或更短的时间。此试剂盒适用于基因组DNA、福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本、ChIP DNA和低起始量的临床样本的建库。NEXTflex Rapid DNA-Seq Kit 样品的起始量范围非常灵活，跨越了3个数量级，从1ng 至1ug 。这是一个基于磁珠纯化、无需电泳进行片段选择的实验方案，多达384种接头可有效运用于多重测序NEXTflex Rapid DNA-Seq Kit与“Enhanced Adapter Ligation Technology ”联合使用，可以有效的连接更长的接头，得到更长的、种类更多的测reads。Bioo Scientific 公司的连接酶与聚合酶预混液可以确保建库过程的高质量进行。
NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 建库结果
A．NEXTflex® Rapid DNA-Seq kit (左)和竞争品牌N’s kit (右)的建库后片段大小覆盖率比较。（实验所用样品相同，每个样品进行3次重复实验，所有样品的纯化和片段选择全部使用AMPureXP beads，数据皆用Agilent 2100分析软件进行分析。）
B．NEXTflex® Rapid DNA-Seq kit和竞争品牌N’s kit连接率的直接比较。图中红色部
分表示的未连接的产物比例；黄色，代表单端连接比例；绿色，代表双端连接比
例。
什么是“Enhanced Ligation Adapter Technology ”
这个试剂盒的特色“Enhanced Ligation Adapter Technology”可在建库时生成大量的不同的测序reads。NEXTflex连接酶混合液的优势在于连接步骤中可连接更长的接头并可达到更好的连接效率。连接酶与传统的T4 DNA 连接酶相比，可以更高效率的(>10 9 ，传统酶的效率为10 6 )修复 DNA缺口，Bioo Scientific 公司已经在建库的接头连接方面取得了革命性的进展。“Enhanced Adapter Ligation Technology”减少接头二聚体和增加双端接头连接效率。用NEXTflex 连接酶混合液，使用者可得到更多不同reads、更丰富的测序多样性和更高的测序覆盖率。
Figure 1. NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit Protocol
多重测序
NEXTflex®接头较长，包含index序列，改进了多重建库实验流程，样本起始量也可进行灵活的选择。这些接头可用于单端测序、双端测序和多重测序。NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 与NEXTflex® DNA Barcodes、NEXTflex-96® DNA Barcodes 和NEXTflex® Dual-Indexed Barcodes搭配用于10 ng或更多的起始材料的建库，也与NEXTflex® ChIP-Seq Barcodes 和NEXTflex-96® ChIP-Seq Barcodes搭配用于少于10ng的起始材料的建库。
产品列表：
| 货号 | 产品名称 | 规格 |
| NOVA-5188-01 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
(NO BARCODES) 8 RXNS |
| NOVA-5188-02 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
(NO BARCODES) 48 RXNS |
| NOVA-5188-03 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
(NO BARCODES)96 RXNS |
| NOVA-5188-11 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
BARCODES 1-8 8 RXNS |
| NOVA-5188-12 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
BARCODES 1-48 48 RXNS |
| NOVA-5188-13 |
NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0 for Illumina® Platforms |
BARCODES 1-96 96 RXNS |
NEXTFLEX® RAPID DNA-SEQ KIT 2.0
PerkinElmer®优化出一款DNA建库试剂盒NEXTFLEX® rapid DNA-seq kit 2.0 ,该试剂盒以片段化基因组DNA为样本，可得到高质量、高产量的DNA测序文库，试剂盒包含文库制备试剂，接头和纯化磁珠。实验室可选择使用NEXTFLEX-HT™ barcodes进行384种样本的多重测序建库，或使用NEXTFLEX® unique dual index barcodes进行192种样本的多重测序建库。
主要特点：
- 稳定的文库产量
- 高质量测序数据
- 基因组覆盖率
- GC偏好性
- mapping速率
- 降低重复率
- 兼容PCR-free实验流程
- 样品起始量低至1ng
- 匹配Sciclone ® G3 NGS自动化工作站
NEXTflex™ ChIP-Seq Kit是为极低起始量的样本进行建库而设计的一款文库制备试剂盒，样本起始量低至1ng的ChIP DNA或genomic DNA ，兼容于Illumina 测序平台。
NEXTflex ChIP-Seq Kit使用BIOO专利Enhanced Adapter Ligation Technology，并以最少的样本起始量得到较高的文库产量。连接酶预混液的功效进一步提升，用户可有效的连接更长的接头，获得更好的连接效果。NEXTflexChIP-Seq Kit采用酶预混试剂和磁珠纯化法，简化了整个实验流程，减少移液步骤和建库消耗的时间。
NEXTflex™ ChIP-Seq Barcodes与Enhanced Adapter Ligation Technology搭配使用，用户可同时处理96种样本，提供一种超强的ChIP测序能力。
NEXTflex™ Bisulfite-Seq Kit可用于简化的表观亚硫酸氢盐测序（RRBS）和全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）文库制备，且适用于Illumina 测序平台上的单端测序、双端测序和多重测序建库。试剂盒中包含NEXTflex™ U+ Polymerase Mix，可以识别出DNA模板中存在的尿嘧啶，并扩增重亚硫酸盐覆盖的模板。
NEXTflex™ Bisulfite-Seq Kit可使用NEXTflex™ Msp1限制性内切酶达到简化表观测序的目的，Msp1限制性内切酶可以单独购买，用于选择富集CpG 区域，从而达到更高的测序深度。NEXTflex Bisulfite-Seq Kit也可不使用Msp1限制性内切酶来进行全基因组甲基化测序分析，包括检测不能在RRBS方法中被富集的CpG 区域。
NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit包含最初的NEXTflex™ DNA Sequencing Kit的所有优点和特别设计的master-mixed enzymes，NEXTflex™ PCR-Free DNA Sequencing Kit完全不需要PCR扩增。扩增AT或GC丰富的基因区域时会引起核苷酸组成序列偏差，并对分析过程造成严重的障碍。使用特别设计
的master-mixed enzymes，NEXTflex PCR-Free DNA Sequencing Kit完全省去了对扩增的需求，能够得到更好的read覆盖率、减少接头二聚体，可降低测序成本和测序偏差，得到更好的短序列组装效果。在评估偏差时，低质量和高GC reads的存在，导致序列不能与参考基因组保持一致。序列高GC含量会导致GC含量随PCR继续提高，这表示基础性表达较差。本试剂盒消除对PCR需求，以消除偏差，获得更多代表性reads。同时，PCR也是引起基因重复的一个重要原因，这样会增加测序成本、接头二聚体和在簇检测中的阻碍。使用NEXTflex PCR-Free Kit试剂盒，用户能够减少重复序列数量，确保得到更良好的reads匹配数。
NEXTflex™ Cell Free DNA-Seq Kit兼容于Illumina 测序平台的测序建库，起始样本量可低至1ng循环肿瘤DNA(ctDNA) 或游离胎儿DNA (cffDNA)。常见的应用包括：利用液体活检进行循环肿瘤细胞（ctDNA）测序和对游离胎儿DNA（cffDNA）测序。
NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq kit构建的文库具有高产量、高覆盖率、低重复率和低GC偏差的优点，适用于Illumina®测序平台。该试剂盒将酶片段化步骤与一个可重复、理想化的单管方案相结合。试剂盒包含酶片段化试剂、文库构建试剂和纯化/片段选择磁珠，整个试剂盒性能已进行优化，确保了高质量文库的构建。NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq文库构建试剂盒可与NEXTFLEX® barcodes搭配使用，提供一个灵活的解决方案。NEXTFLEX®barcodes颜色平衡（color-balanced）且经过专利QC纯度检测，确保测序结果的准确性。
关于NEXTflex® Rapid DNA-Seq Kit 的部分引用文献
- Park H, Oh J, Shim G, et al. In vivo neuronal gene editing via CRISPR–Cas9 amphiphilic nanocomplexes alleviates deficits in mouse models of Alzheimer’s disease[J]. Nature neuroscience, 2019, 22(4): 524.
- Grimm S A, Shimbo T, Takaku M, et al. DNA methylation in mice is influenced by genetics as well as sex and life experience[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 305.
- Qiu Q, Mei H, Deng X, et al. DNA methylation repels targeting of Arabidopsis REF6[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 2063.
- Bencheikh L, Rivière J, Imanci A, et al. Dynamic gene regulation by nuclear colony-stimulating factor 1 receptor in human monocytes and macrophages[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 1935.
- Barbieri I, Tzelepis K, Pandolfini L, et al. Promoter-bound METTL3 maintains myeloid leukaemia by m 6 A-dependent translation control[J]. Nature, 2017, 552(7683): 126.
- Zhang S, Takaku M, Zou L, et al. Reversing SKI–SMAD4-mediated suppression is essential for T H 17 cell differentiation[J]. Nature, 2017, 551(7678): 105.
- Bornelöv S, Reynolds N, Xenophontos M, et al. The nucleosome remodeling and deacetylation complex modulates chromatin structure at sites of active transcription to fine-tune gene expression[J]. Molecular cell, 2018, 71(1): 56-72. e4.
- Raman L, Dheedene A, De Smet M, et al. WisecondorX: improved copy number detection for routine shallow whole-genome sequencing[J]. Nucleic acids research, 2018, 47(4): 1605-1614.
- Zarrillo S, Gaikwad N, Lanaud C, et al. The use and domestication of Theobroma cacao during the mid-Holocene in the upper Amazon[J]. Nature ecology & evolution, 2018, 2(12): 1879.
- Bracewell R R, Bentz B J, Sullivan B T, et al. Rapid neo-sex chromosome evolution and incipient speciation in a major forest pest[J]. Nature communications, 2017, 8(1): 1593.
- Burwitz B J, Wu H L, Abdulhaqq S, et al. Allogeneic stem cell transplantation in fully MHC-matched Mauritian cynomolgus macaques recapitulates diverse human clinical outcomes[J]. Nature communications, 2017, 8(1): 1418.
- Fradin H, Kiontke K, Zegar C, et al. Genome architecture and evolution of a unichromosomal asexual nematode[J]. Current Biology, 2017, 27(19): 2928-2939. e6.
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