特别提示:包括Benzonase核酸酶(无内毒素)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:Benzonase核酸酶(无内毒素)
英文名称:Benzonase Nuclease(Endotoxin free)
产品货号:MT0169
产品规格:25KU|100KU|5000KU
Benzonase Nuclease是一种核酸内切酶,可将核酸降解成2~5个碱基的5‘单磷酸核苷酸,因其能高效降解任何形式(双链,单链,线状,环状)的DNA和RNA而没有蛋白裂解活性,又被称为“全能核酸酶”。Benzonase核酸酶能有效降低蛋白样品粘度,去除蛋白样品中核酸的污染,且无蛋白酶活性残留,核酸酶活性达1×10
6U/mg蛋白。Benzonase核酸酶在降低粘性的同时,也具有多种其他用途,如:减少了样品处理时间,增加了蛋白产量,离心时时沉淀和上清分离的更彻底,更便于溶液的离心(尤其是超滤);提高色谱纯化的效率等。
本公司Benzonase核酸酶包括以下四种:
名称 |
货号 |
Benzonase核酸酶 |
MT0068 |
Benzonase核酸酶(无内毒素) |
MT0169 |
Benzonase核酸酶(Strep II标签) |
MT0170 |
Benzonase核酸酶(Strep II标签,无内毒素) |
MT0171 |
不同Benzonase核酸酶的用途及用量推荐:
实验类型 |
电泳蛋白样品制备 |
非药物蛋白生产 |
药物蛋白生产 |
疫苗、病毒生产 |
细胞药物 |
推荐货号 |
MT0068:科研试剂 |
MT0068:科研试剂
MT0170:Strep II标签 |
MT0169:无内毒素
MT0171:无内毒素,Strep II标签 |
细胞数量 |
1X106个细胞(10mg组织) |
1g湿重(重悬液10mL) |
1L发酵上清液 |
1L培养物 |
最低用量 |
125U(0.5μL) |
25U/mL(1μL) |
25U/mL(1μL) |
0.1U/mL(0.4μL) |
0.1U/mL(0.4μL) |
推荐用量 |
500U(2μL) |
250U/mL(10μL) |
250U/mL(10μL) |
25U/mL(100μL) |
5U/mL(20μL) |
作用时间 |
通常作用时间37℃在15~60min;25℃在30~120min; |
带Strep II标签核酸酶可在消化完核酸后通过Strep Tactin XT Resin(货号:
MT0180)高效去除。
无内毒素的两种Benzonase核酸酶,内毒素含量<40EU/mL(按照单位换算量计算为,每1000U中含有的内毒素<0.15EU),符合FDA关于核酸污染的处理规程,可适用于药用级别的研发和生产。
另外,核酸酶残留可通过我公司开发的基于荧光探针的Benzonase核酸酶残留检测试剂盒(
MT0181)进行评测,15min即可完成检测,最低可检测到2ng/ml的核酸酶残留。
单位定义:
37℃,pH8.0反应条件下,在30分钟内使△A260值降低1.0(相当于完全消化37μg DNA)的酶量定义为一个活性单位。
注意:含大量蛋白、细胞壁、其它盐分的粗制品,对该酶活性有部分抑制作用,使用时需要增加酶的用量。
Benzonase核酸酶的应用:
- 蛋白提取时去除核酸污染:在重组蛋白纯化或组织细胞样品蛋白提取时,Benzonase核酸酶可有效降低样品粘度,利于下游操作;
- 与细胞或细菌裂解液配合使用,去除粗提物中的核酸,降低溶液粘性,提高蛋白质产量;
- 减少存放的外周血单细胞(PBMC)的结块现象;
- 降解核酸,利于不可溶性蛋白复性前高质量包涵体制备;
- 有效去除带负电荷的核酸对双向SDS-PAGE蛋白样品的影响,改善蛋白质的分离效果,增强2-DE分辨率;
- 疫苗和病毒样品制备中DNA污染的去除。
Benzonase核酸酶的应用实例分析:
 |
 |
图1:分别取不同量(0、0.125、0.25、0.5、1、5、10U)的Benzonase核酸酶消化人基因组DNA10min,进行琼脂糖电泳。 |
图2:A为未加Benzonase处理的,B为加Benzonase处理的样品进行二维电泳。如图所示,Benzonase处理的样品可显著增加二维电泳的分辨率。 |
 |
 |
图3:经RIPA裂解未经Benzonase核酸酶处理的样品,大量基因组DNA释放出来,呈鼻涕状。 |
图4:离心后,左管为未加Bezonase核酸酶,有鼻涕状粘稠物质悬浮在管中,右管为加Bezonase核酸酶,上清为透明液体。 |
Benzonase核酸酶具有超强兼容性:
Benzonase核酸酶在非常广泛的条件下,都能保持很高的稳定性和消化核酸的活性,这使其能够与多种细胞裂解液,如RIPA,或含有多种离子和非离子型去污剂、还原剂的蛋白提取试剂等兼容。例如:>100mM的盐酸胍会完全抑制Benzonase活性,1mM的EDTA会部分抑制Benzonase活性,5mM的EDTA会使活性丧失90%,1mM的PMSF则不会抑制核酸酶活性。浓度<0.4%的Triton?X-100对核酸酶活性几乎无影响,<0.4%的脱氧胆酸钠使核酸酶可保持70%的活性,超过该临界值之后核酸酶活性会急剧降低,1%的浓度会使活性丧失70%;0.05%的SDS对核酸酶活性几乎无影响,而SDS浓度在0.1%-1%之间时,核酸酶在变性后活性会急剧降低,可通过增加核酸酶的量使活性得到补偿。另外,核酸酶可耐受6M尿素,当尿素达到7M时,核酸酶在变性后活性会急剧降低,亦可通过增加核酸酶的量使活性得到补偿。
条件参数 |
最适条件 |
可作用条件范围 |
Mg2+ |
1-2mM |
1-10mM |
pH |
8.0–9.2 |
6–10 |
温度 |
37℃ |
0–42℃ |
DTT |
0–100mM |
>100mM |
β-Mercaptoethanol |
0–100mM |
>100mM |
一价阳离子浓度(如Na+,K+) |
0–20mM |
0–150mM |
PO43- |
0–10mM |
0–100mM |
Benzonase核酸酶残留去除:
对于Strep II标签的Benzonase核酸酶(
MT0170,
MT0171)可通过Strep Tactin XT Resin(
MT0180)直接去除,去除率>95%;对于不带标签的Benzonase核酸酶(
MT0068,
MT0169),可通过色谱纯化去除核酸酶,然后可通过核酸酶残留检测试剂盒(
MT0181)或ELISA检测来判断去除是否成功。常见的色谱纯化方式有阳离子交换介质和阴离子交换介质,具体的Benzonase去除条件如下表:
阴离子交换介质 |
pH |
样品和平衡缓冲液 |
Benzonase核酸酶 |
TMAE |
7.0 |
50mM Tris/200mM NaCl |
not bound |
TMAE |
7.0 |
50mM Tris/50mM NaCl |
not bound |
TMAE |
8.0 |
50mM Tris/250mM NaCl |
not bound |
TMAE |
8.0 |
>50mM Tris/100mM NaCl |
not bound |
TMAE |
9.0 |
>50mM Tris/200mM NaCl |
not bound |
TMAE |
9.0 |
50mM Tris/100mM NaCl |
not bound |
DEAE |
7.0 |
50mM Tris/200mM NaCl |
not bound |
DEAE |
7.0 |
50mM Tris/50mM NaCl |
not bound |
DEAE |
8.0 |
50mM Tris/250mM NaCl |
not bound |
DEAE |
8.0 |
>50mM Tris/100mM NaCl |
not bound |
DEAE |
9.0 |
>50mM Tris/250mM NaCl |
not bound |
DEAE |
9.0 |
50mM Tris/50mM NaCl |
not bound |
DMAE |
8.0 |
>50mM Tris/250mM NaCl |
not bound |
DMAE |
8.0 |
50mM Tris/50mM NaCl |
not bound |
阳离子交换介质 |
pH |
样品和平衡缓冲液 |
Benzonase核酸酶 |
SO3- |
6.0 |
20mM phosphate/100mM NaCl |
bound |
SO3- |
6.0 |
20mM phosphate/200mM NaCl |
not bound |
SO3- |
5.0 |
20mM acetate/200mM NaCl |
bound |
SO3- |
5.0 |
>20mM acetate/700mM NaCl |
not bound |
SO3- |
4.0 |
>20mM acetate/300mM NaCl |
bound |
SO3- |
4.0 |
20mM acetate/800mM NaCl |
not bound |
C00- |
6.0 |
20mM phosphate/0mM NaCl |
not bound |
C00- |
5.0 |
20mM acetate/40mM NaCl |
bound |
C00- |
5.0 |
20mM acetate/100mM NaCl |
not bound |
C00- |
4.0 |
>20mM acetate/150mM NaCl |
partially bound |
C00- |
4.0 |
20mM acetate/400mM NaCl |
not bound |
Benzonase核酸酶(无内毒素,货号MT0169)广泛应用于以下用途:
- 蛋白提取时去除核酸污染
- 2D凝胶电泳
- Western Blot
- 生物制药
- 疫苗生产
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名称:BalbRT M-MuLV反转录酶
货号:YT392
规格:2000U
本制品是一种经过改造和优化的M-MuLV反转录酶。和普通的M-MuLV反转录酶相同,BalbRT M-MuLV反转录酶也是一种依赖于RNA或DNA模板的DNA聚合酶,可以以RNA或DNA为模板在引物存在的情况下完成互补DNA链的合成;同时具有Ribonuclease H(RNase H)酶活性,可以选择性剪切RNA和DNA杂合双链中的RNA,但不剪切单链RNA或双链RNA。
特点:
- BalbRT M-MuLV反转录酶可以合成长达13kb的cDNA,而普通的M-MuLV反转录酶仅能合成长达9kb的cDNA;
- BalbRT M-MuLV反转录酶的最适反应温度为42℃并且在50℃时仍然有很高活性,可以避免普通的M-MuLV反转录酶在37℃反应时的一些不足。
用途:
- BalbRT M-MuLV反转录酶常用于在获得总RNA或mRNA后cDNA第一条链的合成。
- BalbRT M-MuLV反转录酶合成的cDNA第一条链后续可以用于PCR、real-time PCR、cDNA第二条链的合成等。
- BalbRT M-MuLV反转录酶也可以用于DNA探针的标记,以及通过引物延伸(primerextention)来分析RNA。
产品组成:
组分 |
规格 |
BalbRT M-MuLV反转录酶(200U/μl) |
2000U |
5×Reaction Buffer |
0.2ml |
保存条件:-20℃保存。
来源:
本BalbRT M-MuLV反转录酶由大肠杆菌表达,表达的基因为经过突变优化的编码Moloney Murine Leukemia Virus reverse transcriptase的pol基因片段。
活性定义:
One unit of the enzyme incorporates 1nmol of dTMP into a polynucleotide fraction in 10min at 37℃.
活性检测条件:
50mM Tris-HCl(pH8.3),6mM MgCl
2,10mM DTT,40mM KCl,0.5mM dTTP,0.4 MBq/ml [
3H]-dTTP,0.4mM polyA·oligo(dT)
12-18。
质量控制:
不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶,不含BalbRT M-MuLV反转录酶本身含有的RNase H酶活力以外的RNA酶,满足常规反转录合成cDNA第一条链等的需要。
酶储存液:
50mM Tris,pH8.3,100mM NaCl,1mM EDTA,5mM DTT,0.1% Triton X-100 and 50% glycerol。
5×Reaction Buffer:
250mM Tris,pH8.3 at 25℃,250mM KCl,20mM MgCl
2,50mM DTT。
失活或抑制:
70℃孵育10分钟可以导致BalbRT M-MuLV反转录酶失活;EDTA、EGTA等螯合剂、无机磷酸盐或焦磷酸盐以及聚氨(polyamine)对BalbRT M-MuLV反转录酶有抑制作用。
使用说明:
1.cDNA第一条链的合成:
- 参考如下表格设置反转录反应:
模板(后面3种任选一种) |
Total RNA |
0.1-5μg |
或Poly(A) RNA/mRNA |
10-500ng |
或Specific RNA |
0.01pg-500ng |
引物(后面3种任选一种) |
Oligo(dT)18 |
0.5μg (或100pmol) |
random hexamer |
0.2μg (或100pmol) |
Gene specific primer |
15-25pmol |
DEPC-treated Water |
- |
To 13.7μl① |
Reaction Buffer (5X) |
- |
4μl |
RNase Inhibitor |
- |
0.5μl② |
dNTP Mix (25mM each) |
- |
0.8μl③ |
BalbRT M-MuLV反转录酶 |
- |
1μl |
总体积 |
|
20μl |
① To 13.7μl表示加入DEPC-treated Water至最终体积为13.7μl。
注意:对于GC含量比较高的RNA模板的反转录反应,加入DEPC-treated Water混匀后微离心,接着可以在65℃孵育5分钟,随后立即置于冰浴以打开RNA的一些比较稳定的二级结构。
② RNase Inhibitor可以视其本身的情况加入适当的量,例如0.5μl或其他适当体积。在加入其他体积时,DEPC-treated Water的用量需适当调整。
③ dNTP浓度不同时使用的体积需作适当调整,此时DEPC-treated Water的用量需适当调整。
- 轻轻混匀(可以用Vortex在最低速度轻轻混匀或用移液器吹打混匀),随后离心沉淀液体。
- 如果使用Oligo(dT)18作为引物或使用基因特异性引物,在42℃孵育60分钟。如果使用random hexamer(随机六聚体)作为引物,先在25℃孵育10分钟,随后在42℃孵育60分钟。注意:对于GC含量比较高的RNA模板的反转录反应,可以设置为45℃孵育60分钟。
- 70℃孵育10分钟以失活BalbRT M-MuLV反转录酶并终止反转录反应。说明:对于长片段的cDNA不推荐采用加热的方法失活BalbRT M-MuLV反转录酶,这种操作可能会导致部分长片段DNA被剪切。
- 反转录产物可以直接用于后续的PCR等反应,也可以-20℃冻存以备以后使用。用于后续PCR反应时,如果PCR的反应体系为50微升,则推荐使用2微升反转录产物。
2.其他用途请自行参考M-MuLV反转录酶的相关文献资料进行。
常见问题:
1.总RNA反转录产物电泳观察不到。
反转录产物由于是从模板反转录而获得,而模板的量本身比较低,反转录的量通常还要少于模板量,因此通常总RNA的反转录产物直接电泳观察是观察不到的。
2.反转录产物通过PCR扩增没有特异性条带。
PCR扩增没有获得特异性条带时建议先使用actin、GAPDH等作为内参进行PCR扩增,看是否可以成功扩增。如果可以成功,则说明PCR扩增体系没有问题,此时通常是目的基因的引物设计欠佳,当然也有可能是反转录产物质量欠佳。如果内参不能被很好地扩增,则有可能PCR体系存在问题或反转录产物质量欠佳。
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