特别提示:包括通用型LAMP试剂盒(双染料)在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:通用型LAMP试剂盒(双染料)
英文名称:Fluorescent and Visual LAMP Kit
产品货号:BTN200601
产品规格:50次
通用型双染料LAMP试剂盒是基于双染料LAMP技术推出的荧光和可见光双模式LAMP扩增及检测试剂盒,它既可以用于荧光LAMP扩增及检测,也可以用于可视化LAMP扩增及检测,适用于各种针对核酸的快速定性检测。
试剂盒特点:
1.一般60分钟内出结果(取决于靶分子浓度),比PCR快约1小时。
2.对20μL的反应体系,最大样品加样量达到14μL。
3.含可见光和荧光染料,既可以用金属浴和水浴扩增用可见光肉眼判断结果,也可用荧光PCR仪进行实时荧光检测。
4.内含的dUTP-UNG可防交叉污染。
5.特异性比PCR高,因为LAMP扩增使用4-6条引物而不是两条。
6.灵敏性可达10拷贝/反应以下(随引物而不同),故假阴性率更低。
7.只可用于科研,只可进行定性检测,不能用于定量检测。
8.本产品只适用于LAMP检测,不适用于进行RT-LAMP检测。
9.本产品足够50次20μL体系的荧光及可视化LAMP扩增。
试剂盒组成:
组分 |
规格 |
4×LAMP MagicMix |
250μL(绿盖) |
4×阳性对照及引物 |
50μL(黄盖) |
保存:-20℃保存,保存期限为一年。
自备试剂:
LAMP模板及LAMP引物、PCR级石蜡油(仅对使用金属浴或水浴者)。
使用方法:
准备工作:
如果使用水浴锅或金属浴,需要在实验启动前打开并调到65℃。如果用金属浴,还必须在孔中加水以填充金属孔和反应管间的空隙。本公司发现很多水浴锅或金属浴温度不准,故建议先用阳性对照和阴性对照测试所用仪器在60℃、62.5℃、65℃、67.5℃和70℃五个温度下扩增效果,选择阳性和阴性颜色差异最大的温度进行扩增。
一、样品DNA的制备
1.用自选方法纯化样品DNA,本试剂盒跟市场上大多数DNA提取试剂盒兼容,可以选购我公司的各种免提取试剂盒,根据样本不同选择不同货号的产品。
2.如果有N个样品,则至少需要做N+2个样品制备,包括一个制备阳性对照(制备时加入自备的跟要检测的靶分子相同的阳性对照模板,一起经历提取过程)和一个制备阴性对照(用水替代样品)。最后N+2个样品一起进行DNA提取操作,得到N+2个DNA样品。
二、配制并测试自备的20×LAMP引物混合液
3.用超纯水将自备的6种(或4种)LAMP引物干粉稀释到母液浓度(100μM),然后按下表配制100μL的20×LAMP引物混合液,此混合液足够100次20μL体系的LAMP扩增。如果需要配制的20×LAMP引物混合液体积异于100μL,则各成分的用量请按比例调整。引物混合液可以在-20℃放置2年。
引物名称 |
母液浓度 |
加母液量 |
在20×LAMP引物
混合液中的浓度 |
FIP引物 |
100μM |
32μL |
32μM |
BIP引物 |
100μM |
32μL |
32μM |
F3引物 |
100μM |
4μL |
4μM |
B3引物 |
100μM |
4μL |
4μM |
Loop F |
100μM |
8μL |
8μM |
Loop B |
100μM |
8μL |
8μM |
超纯水 |
- |
12μL |
- |
注意:总体积为100μL。如果自备的LAMP引物不含Loop引物,则按上表配制时Loop用超纯水替代,使得总体积为100μL。
4.测试引物的非特异扩增:在加模板和不加模板(至少1000拷贝/反应)的LAMP系统中测试引物效果,引物选择标准可以自己掌握,最好选择无模板反应的Ct值比有模板反应的Ct值大60以上(每个循环1分钟)的引物对。根据结果设定判断阴性和阳性结果的阈值(本产品只用于定性)。
如果没有qPCR仪器,只能用肉眼检测,则无需设定阈值,届时靠跟阳性对照和阴性对照管的颜色来判断。
三、LAMP扩增(20μL体系)
5.反应设置:如果有N+2个DNA纯化样品,则最好设置N+5个LAMP扩增,增加扩增阳性对照、无模板对照和无引物对照各1个。在N+5个0.2mL的PCR管中加入下列成分:
成分 |
N+2个
样品管 |
无模板
对照管 |
无引物
对照管 |
扩增
阳性对照管 |
4×LAMP MagicMix |
各5μL |
5μL |
5μL |
5μL |
自备20×引物混合液 |
各1μL |
- |
1μL |
- |
自备N+2个样品DNA |
最多14μL |
同样品管 |
- |
- |
4×阳性对照及引物 |
- |
- |
- |
5μL |
超纯水 |
补到20μL |
补到20μL |
14μL |
10μL |
6.混匀后进行扩增。由于本产品含双染料,可以根据实验室条件选择下列两种方式进行扩增和检测。
7.如果使用金属浴、水浴或普通PCR仪,如果没有热盖,则必须先在每个反应管中加30μL石蜡油,否则保温期间反应体系的水分会蒸发,影响反应效率和颜色显示。65℃保温120分钟。
8.如果使用荧光定量PCR仪:聚合温度设为65℃,1次循环1分钟,120个循环,每分钟在FAM通道采集一次荧光信号。
四、结果分析及解读
9.所有阳性对照有阳性结果(Ct在阈值内或反应液呈蓝色),所有阴性对照有阴性结果(Ct大于阈值或反应液呈淡蓝色),否则提取实验或扩增实验无效。需要寻找原因或跟厂家联系,暂时不需要分析样品的结果。
10.如果阳性和阴性对照结果正常,则实验有效,可以分析样品的情况。如果肉眼观察,样品管的颜色接近扩增阳性对照管则说明有扩增有靶分子,如果接近无模板和无引物的阴性对照,则说明无扩增无靶分子。反应结果示例如下(9为阴性,10为阳性):
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11.如果是用荧光PCR仪,样品Ct将小于阈值则为阳性,大于阈值则为阴性。
12.当实时荧光检测和可视化检测同时使用时,如果不一致,以实时荧光LAMP的数据为准。一般可视化结果滞后实时荧光检测结果20-30分钟,也就是说,在qPCR仪上第30分钟时呈现阳性的样品,其颜色变化在第50-60分钟时才能观察到。
根据您的关注的
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名称:Pfu DNA聚合酶(Pfu酶)
货号:YT372
规格:200U|1000U
pfu DNA聚合酶简称Pfu酶,是最常用的高保真DNA聚合酶之一。Pfu DNA Polymerase是一种来源于嗜热菌Pyrococcus furiosus的高度热稳定的DNA聚合酶。Pfu酶的分子量为90kDa。Pfu酶可以催化5’至3’方向的依赖于DNA模板的脱氧核苷酸的聚合。和Taq酶不同,Pfu酶有3’至5’的外切酶活性(proofreading activity)。另外,Pfu酶有5’至3’外切酶活性,但Pfu酶没有反转录酶活性。
由于Pfu酶有3’至5’的外切酶活性,因此在PCR扩增过程中出错的几率大大降低,出错率为2.6×10e-6。Pfu的出错率不仅远远低于Taq酶,也低于一些其它的高保真DNA聚合酶例如Vent、DeepVent、Pwo、Tli等,因此Pfu酶常作为首选的高性价比的高保真DNA聚合酶。
来源:本Pfu DNA Polymerase为recombinant Pfu DNA Polymerase,通过大肠杆菌表达纯化获得,和纯化获得的天然Pfu DNA Polymerase在各方面的性质相同。
用途:高保真PCR (high fidelity PCR)、点突变、双平端PCR克隆等。
1)Pfu酶扩增出来的DNA片断为双平端,可以用于双平端克隆,但不能用于常规的T载体克隆。
2)dUTP和dITP或含有dUTP和dITP的引物不能用于Pfu酶介导的PCR扩增反应。
活性定义:One unit of the enzyme catalyzes the incorporation of 10nmol of deoxyribonucleotides into a
polynucleotide fraction (adsorbed on DE-81) in 30min at 72℃.Enzyme activity is assayed in the following mixture:20mM Tris-HCl (pH8.8 at 25℃),2mM MgSO4,10mM (NH4)2SO4,10mM KCl,0.1% (v/v) Triton X-100,0.1mg/ml BSA,0.75mM activated calf thymus DNA,0.2mM of each dNTP,0.4 MBq/ml [3H]-dTTP.
纯度:不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶,不含RNA酶,满足常规PCR反应要求。
酶储存溶液:20mM Tris-HCl (pH8.2),1mM DTT,0.1mM EDTA,100mM KCl,0.1% (v/v) Nonidet P40,0.1% (v/v) Tween 20 and 50% (v/v) glycerol。
10×Pfu Buffer (with Mg2+):200mM Tris-HCl (pH8.8 at 25℃),100mM (NH4)2SO4,20mM MgSO4,100mM KCl,1% (v/v) Triton X-100,1mg/ml BSA。
失活或抑制:酚氯fǎng抽提可以使Pfu酶失活。
储存条件:-20℃。
注意事项:
1)由于PCR反应非常灵敏可以扩增目的基因序列超过1000万倍,在使用Pfu酶时请注意避免微量待扩增DNA的污染,并尽量考虑设置不加模板的空白对照以确认是否有待扩增DNA的污染。
2)Pfu DNA polymerase在扩增DNA片断时的出错率非常低,但其扩增效率也比较低。对于出错率要求不高的情况,例如RT-PCR进行定量或半定量,推荐使用Taq DNA polymerase。在扩增效率和出错率需要兼顾的情况,可以选择YTTaq DNA polymerase。在扩增2kb以下DNA片断时,Pfu酶和Taq酶的扩增效率相近。在准确性要求很高的情况下,须选择Pfu酶。
3)Pfu酶有3’至5’的外切酶活性,在没有dNTP的情况下可以降解引物。因此Pfu酶一定要最后加入,并且要在冰浴上操作。
4)不能使用Taq酶的PCR Buffer来替代Pfu酶的PCR Buffer。
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