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StarDrop--指引您进行成功药物发现的软件
英文名称:总访问:8128
国产/进口:进口半年访问:161
产地/品牌:英国产品类别:生物信息软件
型       号:StarDrop 最后更新:2025-2-20
货       号:
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特点和优势
快速识别更有效的化合物
成功的化合物需要许多不同属性达到一个平衡。StarDrop 通过这种多参数优化的方法帮助您锁定有潜力成功的化合物,使您能合成和测试更少的化合物,从而节约时间和财力。

有把握地进行决策
StarDrop能帮助您将药物发现数据中的内在不确定性考虑在内,从而避免错失有价值的潜在化合物。

优化您的化合物
StarDrop能通过高亮关键的构效关系来指导您进行化合物优化。

灵活的整合功能
StarDrop能与您的模型、信息学方法以及数据库进行无缝连接,为用户提供友好的访问这些资源的通道,使项目管理更快、更简单。
1.jpg
Multi-parameter Optimisation
根据项目目标,使用概率评分严格评估化合物的成功潜力
定义您研究项目所需的打分评价文件
针对化合物进行评分以评估其成功可能性
 
2.jpg
Visualisation
分析您的数据,高亮出 patterns,并识别出高质量的化合物
在您项目的化学空间中寻找化合物
生成一个项目数据的交互式面板
 
3.png
SAR Analysis
快速分析和探索您的系列化合物的构效关系
为您的系列化合物创建交互式的SAR表
推断官能团和属性之间的关系
 
4.jpg
Glowing Molecule™
探索属性与结构之间的关系,然后根据即时反馈进行重新设计和优化
重新设计分子以改善其属性
观察结构变化对一个属性的影响
 
突破式数据交互
 
5.png
Sub-structure searching
使用灵活和易于使用的子结构编辑器搜索化合物
包括指定可变linker,以及可变原子和键的标准的独特能力。
 
6.png
Clustering
对相似化合物进行聚类,在不同化合物的数据集中识别化学系列
围绕hits分析SAR,从而对高通量筛选的结果进行分类
或者找出具有良好性能或得分的化合物组。
 
Activity Neighbourhood.png
Activity Cliffs
分析完整的数据集的结构改变和属性变化趋势
并确定结构相似的化合物
同时用箭头标记属性的变化方向和程度
帮助用户发现活性悬崖。
 
8.png
Matched Pair Analysis
通过连接匹配的化合物对来评估化合物的转换
以快速识别化合物发生了哪些取代
以及它们对化合物属性的影响。
 
强大的整合功能
从StarDrop访问您的数据库
StarDrop与您的数据库无缝链接,从而使用户能更快、更方便地访问到项目数据:
● 连接到基于云的数据库和第三方中间设备
● 使用StarDrop的“刷新”功能,立即用数据更新StarDrop的分析

无缝链接到3D对接和比对模型
StarDrop的Pose Generation接口将您专业准备的3D模型与数据可视化、2D SAR分析和预测模型整合到一个单一、简洁的环境中。
● 实时评估多个3D设计迭代
● 与所有主要计算化学供应商兼容
 
将您的模型、脚本和流程方案直接与StarDrop整合与其他信息学平台进行交互,以补充StarDrop的功能:
● 使用内部或第三方模型进行预测
● 从其它平台如Pipeline Pilot™运行自定义脚本或流程方案
● 从您准备好数据的其它平台启动StarDrop来进行可视化和分析

链接到商业和公共数据库
● 寻找商业上可用的筛选化合物和building blocks
● 提取存储在ChEMBL、 PDB和PubChem中的化合物数据

从其它平台与StarDrop交互使用
StarDrop的许多功能也可以从其它平台访问:
● 使用StarDrop的模型进行预测
● 运行使用StarDrop的Auto-Modeller™模块自定义构建的模型
● 根据属性配置文件计算概率评分
integration DIAGRAM.jpg
 
九大功能模块
根据用户需求,可以任意组合使用九大功能模块,实现复杂的计算模拟、代谢/毒性预测、分子对接、创意化合物生成和预测模型构建等功能。

计算模拟功能

ADME QSAR

模块内置了一系列关键ADME性质的高质量预测模型,用于评价小分子的ADME属性,所有的模型均通过毒理数据集严格验证,可以被Glowing Molecule调用指导化合物设计,也可以用于多参数评分,获得属性更为均衡的化合物。

Auto-Modeller™

利用多种先进的机器学习算法,Auto-Modeller模块能够自动构建和验证可靠的QSAR模型。构建的模型同样可被Glowing Molecule和多参数评分调用。

P450

通过量子化学模拟方法,P450模块能够预测化合物的一相代谢反应,为用户提供主要P450酶代谢亚型、代谢位点和代谢产物等全方位的代谢预测结果。

Derek Nexus™

Derek Nexus模块提供了Lhasa公司基于知识规则的毒性评估先进技术,来预测四十多种毒性风险;预测的同时,Derek也提供导致毒性的警示结构,从而帮助重新设计化合物。

创意生成功能

Nova™

通过三种化合物创意策略,帮助用户产生全新的化合物。生成化合物的同时,也可以使用多参数优化功能,实现定向的属性提升。

BIOSTER™

BIOSTER模块提供了27000多个生物类似转化反应,为Nova模块增加了海量的化学创意*。同时所有的化学转化反应均有文献可循,在虚拟创意阶段即兼顾合成经验。

* BIOSTER模块需要和Nova模块联合使用

3D设计功能

SeeSAR™

借助BioSolveIT的分子模拟技术,SeeSAR模块为用户带来全新的3D分子设计体验。SeeSAR模块包含三个子模块:SeeSAR Viewer提供了蛋白—分子的三维可视化视图,来鉴别产生亲和力的关键相互作用;SeeSAR Affinity使用HYDE打分方法来评估化合物的结合亲和力;SeeSAR Pose则利用FlexX对接方法来生成可供虚拟筛选和交互式3D设计的化合物构象。利用以上三个功能,用户可以从分子层面理解化合物的关键相互作用,改造化合物,提升活性。

torch3D™

torch3D模块帮助用户理解并应用 3D SAR来确认和优化新颖的化合物。通过torch3D模块,能够查看分子场,确认关键相互作用,比较化合物的分子场从而找到新颖的活性化合物。

多参数策略功能

MPO Explorer™

作为功能模块的专家模块,MPO模块帮助用户开发多参数优化策略。依托MPO模块,用户可以开发出适合项目目标的多参数评价规则,识别能分辨成功化合物的关键属性,甚至分析每个参数规则的设置是否稳健。

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