Scaffold DIA

Scaffold DIA用于蛋白质组学非数据依赖型（Data-Independent Analysis，DIA）采集方法的定性、定量质谱数据的分析，以及结果验证的统计学分析。

和Scaffold产品线的其他软件类似，Scaffold DIA提供给用户友好的使用界面，提供结果报告及可共享的文件格式，并且为用户提供统计学分析。Scaffold DIA是基于帮助研究者完成基于DIA蛋白组学数据实验的蛋白鉴定、结果整合、总结、优化、定量和结果可视化的软件。

1. 一元化程序：从原始数据到结果
2. 可以搜索FASTA、DIA色谱图library或者Scaffold/Skyline导出的library
3. 不需要保留时间校正肽段
4. 直观的图形用户界面（GUI）
5. 可选择命令行接口

精确的碎片离子定量
使用碎片离子强度进行定量，避免来自母离子的干扰效应。Scaffold DIA进一步地利用碎片离子的峰型和cross-sample的一致性来获得更多的定量可信度。


以蛋白质结果为中心的显示界面
蛋白水平的FDR是由Percolator计算来进行质控的。此外，可调节的蛋白质水平FDR和肽段计数，允许对数据阈值进行调整。通过统计显著性分析、GO分类条目、修饰等对数据进行过滤。


灵活的复杂实验数据的整合
根据实验条件组织样本。定义组分、技术或生物学重复，并且也同时更新了Scaffold DIA统计学分析。


GO分析帮助你深入研究生物学意义
通过在蛋白质鉴定中国添加GO条目来获取对生物学功能的研究。Scaffold DIA提供饼图和聚类图来帮助评估结果的生物学意义。


包含主成分分析（PCA）的内置统计学分析
差异表达的视图和严格的统计检验得到的显著性，均由Scaffold DIA灵活的样品组织所管理。与PCA相结合，为探索性数据分析提供了理想的环境。交互型图形界面允许直接进行结果过滤，以及与其他视图整合。


团队协作以及简化发表
你可以给同事共享Scaffold DIA的文件，可以用免费的Viewer软件来进行查看。Scaffold DIA同时还包含了Excel格式的结果数据导出，以及文章发表级别质量的图像，便于用户直接使用。

康昱盛信息科技有限公司是一家专门提供生物制药领域科学信息整体解决方案的公司。 

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