DNA片段筛选是高通量测序文库构建中的必要步骤,通过Seq-StarTM DNA Size Selection 试剂盒能有效去除文库构建过程中的主要副产物—接头二聚体(图1. A),同时也能筛选得到不同长度分布的高通量测序文库(例300-500bp文库,图1.B)。
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图1. 通过Seq-StarTM DNA Size Selection试剂盒片段筛选后的高通量测序文库. (A) 试剂盒方案I 仅去除接头二聚体后的文库,最终文库完全不含接头二聚体但是片段大小弥散200~1500bp;(B)试剂盒方案II筛选得到的大小峰值在400bp的文库,文库分布集中,片段大小区间为300~500bp。
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图2. Seq-StarTM DNA Size Selection试剂盒对不同片段大小DNA的筛选效果展示。通过调整试剂盒磁珠和50bp DNA Marker的比例,精确回收不同片段大小的DNA片段。
优势
1.无需进行传统胶回收流程,简单可靠,即可单样本也可实现高通量操作;
2.优化的试剂盒体系,筛选结果稳定可重复性高,适用于多类高通量测序文库的构建,RNA测序,基因组DNA测序,MeDIP/hMeDIP测序,ChIP测序等;
3.细化的实验方案,满足不同测序平台(不同读长,单双端测序等)对文库片段大小的需求;
4.对目标区间DNA片段具有高达85%的回收率。
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【表观基因组学】 DNA甲基化芯片、DNA羟甲基化芯片、染色质免疫共沉淀芯片、DNA甲基化测序、DNA羟甲基化测序、染色质免疫共沉淀测序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等
【转录组学】LncRNA芯片、LncPath™芯片、环状RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因组表达谱芯片、RNA测序、RNA m6A甲基化测序、small RNAs测序系列(microRNA测序、tRF&tiRNA测序、snoRNA测序、piRNA测序等)、LC-MS tRNA修饰检测、 nrStar™ ncRNA PCR芯片(tRF&tiRNA,tRNA,snoRNA,Functional LncRNA)、miRStar™癌症特异性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分类PCR芯片、LncRNA实时定量PCR、环状RNA实时定量PCR、tRF&tiRNA实时定量PCR、microRNA实时定量PCR、mRNA实时定量PCR
【蛋白组学平台】TMT标记定量蛋白组学服务、Lable-free定量蛋白组学服务、磷酸化修饰蛋白组学服务、泛素化修饰蛋白组学服务、N-糖基化修饰蛋白组学服务、乙酰化修饰蛋白组学服务、蛋白-蛋白相互作用组学
【代谢组学】靶向代谢组学、非靶向代谢组学
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