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| 销售商： 北京瑞博东方科技有限公司1 | 查看该公司所有产品 >> |
生物信息分析移动解决方案——SEQPAD
生物信息的大数据时代，提取有效内容需超强的计算能力；
生物信息分析软件众多，下载、安装、配置十分复杂；
生物信息的传统服务器，无法移动需联网进行数据上传等操作
SEQPAD是根据多年生物信息分析和大数据处理经验所开发的一套“软硬兼施”的生物信息分析平台。该平台解决个人用户购买服务器价格昂贵、部署麻烦、定制化服务等诸多问题，完美契合中小课题组需求，经济实用，可移动，更便捷。
- 配备精悍的移动服务器硬件系统
推荐的模块组合，在此基础上，还可以提供个性化的定制服务
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组合类型 |
测序分析能力 |
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标准组合 |
转录组：20G(有Ref)/5G(无Ref) micRNA：5G microarray的数据：20G LncRNA：20G …. |
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个性化组合 |
根据客服要求进行安装 |
二.最新最全的专用服务器软件系统
预装linux操作系统，并提供最新最全的生物信息分析软件，强大的软件帮您放大有限的硬件性能。
配备的生物分析软件：
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具体分析工作 |
推荐安装软件 |
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质量控制 |
FastQC、NGSQCToolkit、Trimmomatic |
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转录组分析 |
Tophat、Cufflinks、bowtie、Samtools、IGV、Rfam、GATK、VCFtools、VarScan等 |
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转录组组装 |
Trinity等 |
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进化分析 |
Structure、admixture等 |
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miRNA分析 |
Bedtools、CutAdapt、HTSeq、Picard、miRDeep2、Vienna、Squid、RandFold、PDF-API2、miRanda、DIANA-microT等 |
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序列比对 |
BLAST、FASTA等 |
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芯片数据分析 |
gPLINK、plink等 |
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长链非编码RNA分析 |
CPAT |
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数据可视化 |
R语言、Rstudio等 |
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底层软件 |
Perl、Python、Cython等 |
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Rpackage |
edgeR、DESeq、cummeRbund、rrBLUP、genetics等200个package |
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R code |
主成分分析、离散程度分析、网络可视化等等 |
三．最全面的分析服务培训
SEQPAD支持个性化的方案设计，为您提供为期两周的RNA-seq、micRNA、芯片等数据的全套分析流程培训内容。
