人细胞凋亡PCR芯片

PCR ARRAY介绍
PCR ARRAY又称PCR芯片，运用高通量荧光定量PCR方法，在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的表达量变化进行检测，芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因；目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因设计了150多款功能分类PCR芯片，涵盖生命科学研究的各个领域。
人细胞凋亡PCR芯片介绍
   启因生物的人细胞凋亡ARRAY含有84个与人细胞凋亡相关的基因，包括促凋亡基因，抗凋亡基因，细胞损伤基因，凋亡调节基因等。
产品说明

产品名称	人细胞凋亡PCR芯片
英文名称	Human Apoptosis PCR Array
货    号	sp-TWCPAHM-0001
基因数目	84个
基因名称	见基因列表
检测费用	800元/样
样本类型	细胞，组织等
项目周期	2周（不含节假日）
实验结果	原始数据，数据分析
技术原理	*相对定量，SYBR Green法

*相对定量：用于测定一个测试样本中目标基因与校正样本中同一基因表达的相对变化。校正样本可以是一个未经处理的对照或者是在一个实验研究中处于零时的样本。
服务特点

• 只需提供样品
• 数据分析多样性选择
• 中低通量，一次性检测多个相关基因的表达水平
• 周期短
• 结果不需要QPCR验证

服务流程

• 确定实验方案，签合同
• 样品寄出（-80℃顺丰寄出）
• 收样后进行质控
• 质控过关，上机检测
• 数据分析

样品预处理方法
为了避免样品中RNA降解，需对样品进行预处理。

样品类型	处理方法	送样量
贴壁细胞	①倒出培养液，用 1×PBS 清洗一次。 ② 每 10 cm2生长的培养细胞中加入 1-2 ml 的trizol，轻微晃动，确保使裂解液均匀分布于细胞表面。③ 将内含细胞的裂解液转移至离心管中，-80℃保存	至少1×106个细胞
悬浮细胞	①将悬浮培养细胞连同培养液一起倒入离心管中，8,000 g 4℃离心2 分钟，弃上清。 ② 向细胞中加入 1 ml 的 trizol，-80℃保存	至少1×106个细胞
组织（动物器官类）	离心管中加1 ml 的 trizol，确保浸没组织，-80℃保存	至少20mg,约小黄豆大小

 
检测流程：

• 样品总RNA提取
• RNA质量检测，检测RNA纯度及完整度，提供RNA质量报告；
• cDNA合成，使用逆转录酶，将样品RNA逆转录为cDNA；
• 实时定量PCR反应；
• 数据分析，计算PCR芯片中的各个Ct值，采用ΔΔCt方法比较基因的表达变化，并利用公司自主开发的数据分析软件进行比较。

 

基因列表 
Induction of Apoptosis:
Death Domain Receptors: CRADD, FADD, TNF, TNFRSF10B (DR5).
DNA Damage: ABL1, CIDEA, CIDEB, TP53, TP73.
Extracellular Signals: CFLAR (CASPER), DAPK1, TNFRSF25 (DR3).
Other: BAD, BAK1, BAX, BCL10, BCL2L11, BID, BIK, BNIP3, BNIP3L, CASP1 (ICE), CASP10 (MCH4), CASP14, CASP2, CASP3, CASP4, CASP6, CASP8, CD27 (TNFRSF7), CD70 (TNFSF7), CYCS, DFFA, DIABLO (SMAC), FAS (TNFRSF6), FASLG (TNFSF6), GADD45A, HRK, LTA (TNFB), NOD1 (CARD4), PYCARD (TMS1/ASC), TNFRSF10A, TNFRSF9, TNFSF10 (TRAIL), TNFSF8, TP53BP2, TRADD, TRAF3.
Anti-Apoptosis: AKT1, BAG1, BAG3, BAX, BCL2, BCL2A1 (Bfl-1/A1), BCL2L1 (BCL-X), BCL2L10, BCL2L2, BFAR, BIRC3 (c-IAP1), BIRC5, BIRC6, BNIP2, BNIP3, BNIP3L, BRAF, CD27 (TNFRSF7), CD40LG (TNFSF5), CFLAR (CASPER), DAPK1, FAS (TNFRSF6), HRK, IGF1R, IL10, MCL1, NAIP (BIRC1), NFKB1, NOL3, RIPK2, TNF, XIAP (BIRC4).
Regulation of Apoptosis:
Negative Regulation: BAG1, BAG3, BCL10, BCL2, BCL2A1 (Bfl-1/A1), BCL2L1 (BCL-X), BCL2L10, BCL2L2, BFAR, BIRC2 (c-IAP2), BIRC3 (c-IAP1), BIRC6, BNIP2, BNIP3, BNIP3L, BRAF, CASP3, CD27 (TNFRSF7), CD40LG (TNFSF5), CFLAR (CASPER), CIDEA, DAPK1, DFFA, FAS (TNFRSF6), IGF1R, MCL1, NAIP (BIRC1), NOL3, TP53, TP73, XIAP (BIRC4).
Positive Regulation: ABL1, AKT1, BAD, BAK1, BAX, BCL2L11, BID, BIK, BNIP3, BNIP3L, CASP1 (ICE), CASP10 (MCH4), CASP14, CASP2, CASP4, CASP6, CASP8, CD40 (TNFRSF5), CD70 (TNFSF7), CIDEB, CRADD, FADD, FASLG (TNFSF6), HRK, LTA (TNFB), LTBR, NOD1 (CARD4), PYCARD (TMS1/ASC), RIPK2, TNF, TNFRSF10A, TNFRSF10B (DR5), TNFRSF25 (DR3), TNFRSF9, TNFSF10 (TRAIL), TNFSF8, TP53, TP53BP2, TRADD, TRAF2, TRAF3.
DEATH Domain Proteins: CRADD, DAPK1, FADD, TNFRSF10A, TNFRSF10B (DR5), TNFRSF11B, TNFRSF1A, TNFRSF1B, TNFRSF21, TNFRSF25 (DR3), TRADD.
Caspases and Regulators: 
Caspases: CASP1 (ICE), CASP10 (MCH4), CASP14, CASP2, CASP3, CASP4, CASP5, CASP6, CASP7, CASP8, CASP9, CFLAR (CASPER), CRADD, PYCARD (TMS1/ASC).
Caspase Activators: AIFM1 (PDCD8), APAF1, BAX, BCL2L10, CASP1 (ICE), CASP9, NOD1 (CARD4), PYCARD (TMS1/ASC), TNFRSF10A, TNFRSF10B (DR5), TP53. 
Caspase inhibitors: CD27 (TNFRSF7), XIAP (BIRC4).
 
参考文献
Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)
Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)
Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.（IF6.065）
 

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        上海启因生物科技有限公司是一家专业提供生命医学前沿研究技术的高科技企业。专门为生物医学领域的研究创新和产品开发提供新技术、新产品。目前是国内唯一能够同时进行384孔最低反应体系为1ul的高通量实时荧光定量PCR服务平台，极大提高了实验效率，降低试验成本。依托此平台，可以提供miRNAPCR芯片以及50多种细胞信号通路相关基因的PCR芯片等多种PCR芯片的技术服务。