交大Scientific Reports发文构建世界首个蛋白质芯片数据库

博翀生物战略合作单位上海交通大学系统生物医学研究院陶生策老师等构建了世界上首个蛋白质芯片数据库，该数据库针对蛋白质芯片的特点，设计了一套蛋白质芯片数据储存标准，以及提供了在线“一键式”蛋白质芯片数据分析工具。2016年1月27日，该研究成果发表在Nature子刊《Scientific Reports》。

蛋白质芯片是一项强大的蛋白质组学研究技术，该技术已被广泛地用于基础研究和临床研究。到目前为止已累计了大量的原始芯片实验数据，但仍缺乏一个专门为蛋白质芯片量身打造的数据库, 不能有效地共享以进一步发挥数据的价值。对此，本研究构建了一个蛋白质芯片数据库PMD（www.proteinmicroarray.cn），作为专门储存和分享蛋白质芯片原始数据的公共数据库平台。

目前，PMD已经收录了多种不同类型的蛋白质芯片数据，如蛋白质组芯片、抗体芯片和凝集素芯片等。另外，为了方便那些对蛋白质芯片数据感兴趣的用户挖掘数据信息，PMD还整合了多个关键的生物芯片和蛋白质组数据分析工具，提供了一个自动化的数据分析接口，用户提交后原始数据后，PMD将自动完成分析并生产完整的分析报告待用户下载。完整的分析报告包括数据标准化结果、差异信号点筛选结果、聚类和注释结果等。

PMD是首个专门储存和分享蛋白质芯片数据的公共平台。在该数据库中，用户可“一站式”获取蛋白质芯片实验的数据和相关信息，具体包括原始芯片数据、芯片信息和芯片文章信息等。与此同时，用户还可利用数据库内嵌的“一键式”数据分析工具来进行蛋白质芯片数据的分析和深度挖掘。该数据库的成功建立必将为推动蛋白芯片技术的广泛应用、蛋白组学研究的飞速发展起到至关重要的作用。PMD数据库也必将成为中国人类蛋白质组计划（CNHPP）推进过程中一个极其重要的科学成果。

广州博翀生物科技有限公司专注于蛋白质芯片研究领域，提供最专业的蛋白质芯片产品、服务和平台，推动基于蛋白质芯片的蛋白质组学发展和蛋白质芯片的临床应用。陶生策研究员作为广州博翀生物科技有限公司战略指导专家，对我司芯片产品的研发、生产以及技术服务等给予了许多支持与帮助。

文章链接：http://www.nature.com/articles/srep19956