罗氏454测序应用于花生种子败育研究

浏览次数：2971　发布日期：2012-12-5　来源：本站　本站原创，转载请注明出处

454测序应用于花生种子败育研究

花生为豆科作物，是我国优质食用油主要油料品种之一，又名“落花生”或“长生果”，在全国各地均有种植，主要分布于辽宁、山东、河北、河南、江苏、福建、广东、广西、贵州、四川等地区。在花生种子的生长发育过程中，胚栓插入土壤，膨压将种皮推开后露出胚轴是一个重要过程，因此，胚栓入土失败、胚轴的膨压都有可能导致花生种子收益的损失。

近期，国内学者们使用454测序平台对花生种子的转录组进行了研究¹，通过对地面上与地下的种子转录组cDNA文库进行测序与拼接，获得了近30,000条contig序列。在与已知数据库及其他模式植物的转录组进行了注释、功能上和代谢通路上的比较之后，发现光合作用通路在地面上的种子里有显著富集，并找到一些与在地面上的种子败育的潜在基因。

1. Chen, X., Zhu, W., Azam, S., Li, H., Zhu, F., Li, H., Hong, Y., Liu, H., Zhang, E., Wu, H., Yu, S., Zhou, G., Li, S., Zhong, N., Wen, S., Li, X., Knapp, S. J., Ozias-Akins, P., Varshney, R. K. and Liang, X. (2012), Deep sequencing analysis of the transcriptomes of peanut aerial and subterranean young pods identifies candidate genes related to early embryo abortion. Plant Biotechnology Journal. doi: 10.1111/pbi.12018

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