2011罗氏诊断454二代测序平台技术研讨会在京沪举行

 

罗氏诊断应用科学部于9月19日及21日分别在上海和北京举办“2011罗氏诊断454二代测序技术新进研讨会”。本次研讨会邀请来自高等院校、医院、科研院的近100位新老客户参加，在此次会议上罗氏诊断应用科学部隆重推出了454二代测序技术家族中最新升级的GS FLX+ 测序仪，并邀请国内外专家就454系统的特长优势及应用领域进行介绍及经验分享。

 

 

在会议上，罗氏诊断全球产品经理Xuemin Liu博士、杜克大学神经生物学Erich Jarvis教授、德国IMGM Laboratories项目经理Stefan Kotschote先生、中国医学科学院中国协和医科大学药用植物研究所 孙超教授及李滢老师及上海众信生物技术有限公司何有裕总经理相继对产品特长及相关应用进行了深入细致的介绍，并分享了应用454系统开展的项目案例以及实践经验。与会者颇为关注，并在互动环节上提问积极，表现了对新产品相当的关注度。

 

GS FLX+系统是罗氏诊断应用科学部在今年下半年推出的基于原有GS FLX系统升级的二代测序仪。 据Xuemin Liu博士介绍，GS FLX+系统既可以通过购买新仪器获得，也可以在原有GS FLX系统上进行设备升级获得。升级后的设备具有：（1）超长读长，单读长可达1000bp，45%的测序读长超过700bp ，85%的测序读长超过500bp；（2）提高后通量，一次运行可获得1,000,000条测序读出，典型通量达700Mb总量；（3）准确率高，以15倍覆盖的大肠杆菌基因组测序为例，准确度达99.997%；（4）快速，单次运行仅需23小时同时可以进行序列分析，升级后的运算处理设备（HP Z800）配合454分析软件解读生物信息；（5）广泛应用，超长度长优势在全新基因组拼接，复杂基因组研究，序列捕获定向测序，扩增子测序，转录组全新拼接，宏基因组以及高度可变基因组区域有独有优势。

 

 

Erich Jarvis教授多年来致力于鸟类发声学习的研究，通过全基因组测序拼接的结果，获得与之相关的基因，了解该性状的发生过程并推测各个品种间进化关系。Erich Jarvis教授指出，454系列产品尤其最新的FLX+系统的长度长优势很好的完成了parrot基因组的拼接任务，通过与其他平台的比较，长度长对于挺高了contig及scarfold的大小降低对于生物信息学数据处理的要求有非常明显的优势。

 

 

Stefan Kotshote先生所在的IMGM实验室多年以来为医疗诊断、药物实验室、科研院校以及生物企业提供测序等高通量平台服务。此次Kotschote先生分享了使用454平台的经验，介绍了各种序列捕获技术与扩增子在定向测序中的应用，介绍了454测序技术在Medical Sequencing领域的成功案例。他特别强调了生物信息技术对于二代测序结果利用程度的重要性，454测序质量与长度对于获得有用的序列信息进而得到相关生物意义非常有帮助。　　

 

报告题目：《 454高通量测序技术在药用植物研究中的应用》

 

植物基因组研究是目前我国基因组学研究的热点之一，包括农作物以及中医药用植物等，而由于其多倍体以及自杂交等特性又是测序拼接的难点。北京药用植物研究所是国内最早开始使用454平台进行研究的实验室之一，已经摸索出了较为成熟的转录组研究实验方案，利用454平台长度和质量特点，通过有限的运行次数就可以获得高质量的转录组拼接，发表了多篇过有国际影响力的相关文章。也表明了该平台在植物基因组研究方面的优势。

 

 

何有裕先生是国内知名技术服务公司众信生物技术的首席科学家，该公司主业务以二代测序平台为核心。何博士介绍对于实验室建立二代实验平台经验，在仪器采购，人员配置，实验室管理，实验设计各个环节，实验数据保存和分析给出了详细中肯的建议意见，获得了与会者的良好回应。

 

 

罗氏454 测序平台一直以来注重产品的持续性发展，不但通过推出GS Junior系统为小型试验室及小型测序平台带来技术触手可及的二代测序技术，而且同时关注经典的大规模测序的GS FLX系统的发展，在保证测序质量的基础不断延伸单个读长长度，提高总通量，是二代测序领域中读长长度与测序质量完美结合的代表。

GS FLX+系统该系统通过改进设备硬件、实验试剂以及软件升级，使得单个读长已经可以达到1,000bp，到达传统毛细管电泳的检测长度，同时也具有可以与之媲美的测序质量，期望在不久的将来能够广泛替代传统测序系统。延伸后的读长，同时保证了更大的测序通量，从而降低测序成本。应用于基因组图谱全新拼接及转录组测序可以得到更完整覆盖，定向测定可以扩展到捕获序列间隙的片段，宏基因组研究可以更准确的鉴定物种及分辨相似品系。

   

 

　　关于罗氏诊断：

 

　　罗氏总部位于瑞士巴塞尔，是全球在医药和诊断领域，致力于研究并处于领先地位之一的保健集团。罗氏的诊断部门提供了独一无二的产品品种，为全世界的研究人员、医师、病人、医院和实验室提供多样化的创新测试产品及服务。罗氏诊断在全球有近19,000人员正致力于科研、发展、产品的市场运作和服务以及一体化的解决方案。

 

　　关于罗氏诊断应用科学部：

 

　　罗氏的诊断部门在成功收购德国宝灵曼公司(Boehringer Mannheim GmbH.)后，成立了专业服务于科学研究领域用户的罗氏应用科学部(Roche Applied Science)，凭借半个多世纪在生命科学研究领域积累的经验，罗氏应用科学部已成为在此领域中具领先地位的试剂及系统供应商之一。