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罗氏454和Integrated DNA技术公司就引物设计和供应达成全球独家协议

浏览次数:5045 发布日期:2008-12-30  来源:本站 本站原创,转载请注明出处
454 生命科学( 罗氏子公司) 和美国集成DNA 技术公司( Integrated DNATechnologies, Inc.)今天宣布,他们已经达成了一项独家的共同促销协议,其中IDT负责设计、合成并纯化454测序应用中必需的融合引物。这些应用包括用于检测疾病相关基因的低频率突变的超深度扩增子测序,和群体中常见的和稀有变异体的综合鉴定和定量。这次的合作为Genome Sequencer FLX的用户提供了引物合成的便利方案,简化了工作流程,减轻了用户在生物信息学方面的负担。

IDT简明易用的在线融合引物设计工具可利用提供的对照序列来构建针对目标DNA区域的相应的454融合引物。这些DNA区域可包括单个外显子或一个甚至多个基因的所有外显子。DNA二级结构,如发夹结构,可能会影响引物的性能。这个软件考虑了整个融合引物的性能,而不是简单地在其他标准PCR引物上加个454的通用接头。除了454FusionPrimer设计,IDT在高保真合成和HPLC纯化上也很有经验,有助于研究人员获得
454测序的最高品质数据。

“我们很高兴利用了IDT在引物设计和合成上的丰富经验,来为我们的客户提供了目标重测序计划的一站式解决方案。”454生命科学的CEO Chris McLeod表示,“把引物设计的任务交给IDT的在线工具来完成,研究人员现在能集中更多精力来实现探索。”

作为唯一能实现序列读长超过400 bp的新一代测序技术,Genome Sequencer FLX系统可实现包括全部外显子和其他基因组区域的单体型分析在内的综合分析。该系统高度精确、超长序列读长促使一系列强大应用成为可能,新的引物设计工具进一步简化了这些工作。其中包括检测癌症样品中低频率体细胞突变的超深度测序,HIV感染个体的稀有变异探索,疾病相关区域外显子序列分析,通过全基因组联合分析和对16S核糖体RNA区域的鉴定来描绘出宏基因组样品中的微生物丰度和多样性。

454 生命科学是罗氏应用科学旗下卓越的中心之一,开发并商业化了创新的454 测序系统,用于超高通量的DNA 测序。具体的应用包括基因组的从头测序和重测序、宏基因组学、RNA 分析和DNA 目标区域的定向测序。454 测序系统的特点是样品制备简单且无偏向性,读长包括配对末端读长超长且准确度高。454 测序系统的技术已经催生了各个研究领域的几百项经同行评议的研究,例如癌症和传染病研究、药物筛选、海洋生物学、人类学、古生物学等多个方面。更多信息,请查看http:///。


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