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1577 次 单细胞转录组测序与类器官联合在HPV病毒研究中的新思路 2023-9-4
感染高危型人乳头瘤病毒(HPV)导致全世界5%的癌症，包括宫颈癌和口咽癌。HPV16占大多数，并且持续的角质形成细胞感染是主要的危险因素。病毒癌基因在人类致癌中的作用已经被深入研究了几十年，分
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532 次 DSP助力同质癌细胞进行药物治疗后的克隆命运研究 2023-8-28
即使在基因相同的癌细胞中，对治疗的抵抗也经常出现在这些细胞的一小部分中。初始群体中稀有单个细胞的分子差异使某些细胞对治疗产生耐药性；然而，人们对耐药结果的变异性知之甚少。在此研究中
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981 次 单细胞转录组：聚类分析中的机器学习与统计方法综述（三） 2023-8-28
接上回，在单细胞转录组 | 聚类分析中的机器学习与统计方法综述（一）和单细胞转录组 | 聚类分析中的机器学习与统计方法综述（二）中，综述了在过去几年间发展起来的，用于单细胞转录组分析中聚
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637 次 DSP空间转录组揭示非小细胞肺癌肿瘤内异质性并发掘空间分子标志物 2023-8-28
本研究回顾性纳入18例接受双特异性抗体（bsAb）治疗的NSCLC晚期患者（aNSCLC），采用GeoMx®protein和CTA检测方案，结合特定细胞类型的圈选策略（Segmentation），分别获得了肿瘤区域和基质区
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609 次 DSP平台助力揭示Y染色体丢失通过适应性免疫逃逸来驱动肿瘤生长 2023-8-28
染色体缺失（LOY）与膀胱癌有关（10-40%），但其临床和生物学意义尚不清楚。本研究对自然发生的LOY突变型膀胱癌细胞以及通过CRISPR-Cas9靶向缺失Y染色体的细胞进行了深入的研究。结果发现，Y阳性
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1062 次 DSP空间多组学技术常见问题解答及空间生物学解决方案 2023-8-28
空间多组学领域的“新晋顶流”——GeoMx®Digital Spatial Profiler（DSP）全面空间生物学解决方案一经问世便备受关注。已经有不少科研人率先尝试采用该技术开展课题研究
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716 次 DAP-seq技术在棉花体细胞胚胎发生（SE）研究中的应用 2023-8-8
体细胞胚胎发生（Somatic embryogenesis,SE）可以不经过配子融合，由体细胞分化发育成整个植株。SE是一个多因素的发育过程，也是研究细胞全能性的理想模型。目前，SE在多个领域得到了应用，例如
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663 次 单细胞+空间转录组测序在类器官研究中的研究思路 2023-8-8
类器官作为一种体外细胞模型，利用单细胞测序技术可以获得非常接近体内器官的基因组特征，通过结合空间转录组测序进一步得出各类细胞的空间分布特征，适用于多个领域的研究。● 研究思路 ●01对
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579 次 单细胞空间多组学技术描绘人类乳腺细胞图谱 2023-8-8
人类细胞图谱计划（Human Cell Atlas，HCA）旨在描述人体中每个细胞（约37万亿个）的详细特征，呈现不同类型细胞在人体组织的三维结构，勾勒他们在人体系统内的联系，揭示图谱变化与健康和疾病的
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694 次 8种表观转录组m6A MeRIP-seq的差异甲基化区域（DMR）分析软件比较 2023-7-21
RNA甲基化是近年来研究基因表达调控转录后变化的重要研究领域，包括N6-甲基腺苷（m6A）在内的各种类型RNA甲基化参与人类疾病发展。MeRIP-seq作为一种新兴的在转录组范围内定量检测m6A水平的测序
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592 次 DAP-seq技术在MdWRKY115调控苹果干旱和渗透胁迫耐受研究中的应用 2023-7-14
苹果是一种重要的落叶果树，广泛种植在半干旱和干旱地区。干旱胁迫会严重影响苹果的生长、品质和产量。WRKY转录因子在植物非生物胁迫响应中起关键作用。然而，苹果中WRKY转录因子响应干旱和渗透
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1007 次 案例解析：酶Suclg2通过抑制Lactb琥珀酰化维持树突状细胞的耐受性 2023-7-7
代谢重编程在包括树突状细胞 (DCs) 在内的免疫细胞的分化和功能中起着关键作用。调节性 DCs 可在脾基质等局部组织壁龛中产生，是维持免疫耐受的基质调控免疫应答的重要组成部分。代谢酶和代谢物
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544 次 Plant Physiology：DAP-seq在毛白杨干旱胁迫响应机制研究中的应用 2023-7-6
干旱胁迫限制了树木的生长，并影响其地域性分布。为了应对干旱胁迫，植物进化出了一系列的生理生化反应机制，以保护植物细胞免受损害。因此，研究干旱胁迫下树木生理和光合作用变化的分子机制，
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1505 次 植物转录因子研究的利器—DAP-seq技术 2023-7-3
转录因子(Transcription Factor，TF)是能够与基因5'端上游特定序列专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的一类蛋白质分子。转录因子在植物的生长发育及其对外界环境
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526 次 DAP-seq技术在ZmEREB57调控OPDA合成提高玉米耐盐性研究中的应用 2023-6-30
茉莉酸类化合物（JAs）是植物中普遍存在的一类植物激素，在非生物胁迫响应中发挥重要作用。12-氧-植物二烯酸（OPDA）可通过α-亚麻酸（ALA）代谢途径合成JA，是一种重要的JA前体分子。APETARA2/
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788 次 结合单细胞和空间转录组揭示乳腺癌传播过程中的代谢演变 2023-6-6
期刊：ADVANCED SCIENCE影响因子：17.521导语乳腺癌已成为全球范围内最常见的恶性肿瘤，占女性癌症的近30%。由于治疗手段的快速发展，大多数非转移性乳腺癌患者是可以治愈的。腋窝淋巴结状态是决
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1360 次 多组学（表观组+转录组+微生物组）关联分析及组学分子实验验证方法 2023-5-16
生物过程具有复杂性和整体性，单组学数据难以系统全面解析复杂生理过程的分子调控机制。而多组学（Multi-omics）联合分析可同时实现从“因”和“果”两个层面研究生物学问题
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613 次 油菜素内酯（BR）调控棉花纤维伸长新机制 2023-5-15
棉花是世界上最重要的天然纤维作物，棉纤维细胞是植物中最长的单细胞之一，为研究细胞伸长提供了理想的模型。油菜素内酯（BR）在调节纤维伸长方面发挥重要作用，并且BR在棉花生产中已广泛应用。
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577 次 scRNA-seq及DAP-seq技术联合应用揭示比克氏棉色素腺的发育及转录调控 2023-5-15
色素腺体是棉属及其近缘植物所特有的防御结构，其内含物棉酚能够提高棉花对病虫害的抗性。但是，由于色素腺及棉籽酚的存在，限制了棉籽的综合利用。理想的棉花是种子无腺体和植株有腺体，这一特
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677 次 DAP-seq技术在苹果根系抵御腐皮镰刀菌侵染分子机制研究中的应用 2023-5-15
腐皮镰刀菌是苹果重茬连作障碍（ADR）的主要致病菌，严重损害苹果根系，抑制苹果植株正常生长。然而，苹果抵御腐皮镰刀菌的分子机制尚不清楚。因此，本研究对苹果和腐皮镰刀菌之间的相互作用机制