English | 中文版 | 手机版 企业登录 | 个人登录 | 邮件订阅
厂商 仪器 试剂 服务 新闻 文章 视频 高级搜索
当前位置 > 首页 > 技术文章 > Ion PGM™微生物测序解决方案
Ion PGM™微生物测序解决方案
点击次数:2451 发布日期:2019-1-3  来源:本站 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负
半导体测序
      Ion半导体测序让测序既快速,又经济。如今,更多实验室采用强大的新一代测序技术——通量增加,准确性提高,读取更长——以便更快获得微生物的答案。有了Ion Torrent™个人化操作基因组测序仪(PGM™),您能够从基因组定向区域(如多位点序列分型(MLST))的测序更快推进到完整基因组的测序,而费用仅为毛细管电泳测序的一小部分。有了全基因组鸟枪法测序(WGS),您能够捕获整个基因组中的单碱基改变,而无需物种的参考序列信息。
 
成熟:在短短两年的时间内,科学家们已利用Ion PGM™测序仪发表了80多篇微生物学方面的同行评议文章。
简约:经济的全基因组测序让微生物学家能够在使用单一技术时提高鉴别能力和准确性。
快速:Ion PGM™测序仪比其他测序仪更快,只需4小时即可获得长读取(400个碱基)测序结果。

微生物测序单日流程
      目前对于较长、准确的读取(reads),采用400个碱基对的测序可在一天之内完成由Ion PGM系统动力操纵的de novo测序。
      简化的样品制备和应用特异的数据分析方案进一步简化了微生物测序,使得微生物研究的各个领域都有重大突破。
       三种测序芯片可供选择,意味着您能够根据特定应用的需求来选择测序通量,从而节省您的时间和经费。

微生物测序应用
发现 & 鉴定
      全基因组鸟枪法测序为微生物的发现与鉴定提供了重要的新机会。对于鉴定微生物基因组结构的研究人员而言,完整基因组的de novo测序和组装是至关重要的一步。Ion Torrent™半导体测序彻底改变了微生物研究中的de novo测序,它提供了一个简单、低成本的系统,能在一天内带来准确的结果。随着在Ion PGM™系统上实现400 bp测序,测序组装指标将比以往任何时候都好,带您走上全基因组测序的捷径。
 
细菌分型
       快速准确的分型对于监测或鉴别细菌或病毒、阐释细菌传播链或了解特定人群的健康和疾病状况均十分重要。Ion半导体测序匹配Ridom™ SeqSphere+™自动化软件能够使任何微生物学家得以利用全基因组的方法来实现细菌分型。Ion PGM™系统能够提供快速、低成本的完整基因组序列信息,而不是仅对几个感兴趣的区域进行测序。通过采用成百上千个分型基因,可对个别菌株实现更高分辨率和更为准确的分型。在一个工作日内,即可对特定分离株进行测序和鉴定,从而有望为疾病爆发的监测提供实时结果。
 
病毒分型
      为了集中目标完成进化模式和病原体出现的预测,Ion PGM™系统匹配PathAmp™ FluA试剂以及Torrent Suite™软件的病原体分析仪插件为甲型流感病毒完整基因组测序提供了最新型的工作流程。利用高度准确的序列数据,研究人员能够在一天之内实现甲型流感病毒的分型,从而启动更为有效的流感监测。这可使您得以精心优选疫苗菌株,并改进未来抗原特性的预测。
 
宏基因组学
       Ion半导体测序通过全基因组测序或对细菌16S rRNA基因的定向测序(16S测序)来加速和简化宏基因组研究。因无需在测序之前克隆样品,避免了抽样时的一个主要偏向。样品在Ion PGM™系统上的直接测序可快速开展,有了更多扩增子,可更好地区分不同生物体。与其他新一代测序仪不同,PGM™系统让您轻松读取低复杂度的序列。
来源:南京新惠通生物科技有限公司
联系电话:025-66062828
E-mail:13739196679@126.com

网友评论 已有[0]人评论
用户名: 密码: 匿名 快速注册 忘记密码
评论只代表网友观点,不代表本站观点。 请输入验证码: 8795
Copyright(C) 1998-2019 生物器材网 电话:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com