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康成独家推出特色Small RNAs测序系列技术服务
点击次数:6006 发布日期:2016-9-1  来源:康成生物
小RNA是一类长度小于200nt、不具蛋白编码能力的RNA分子,主要包含microRNA、tRF&tiRNA、sdRNA、piRNA、tRNA、snoRNA以及pre-microRNA等种类。作为重要的调控分子,小RNA在基因表达、表观遗传、疾病发生发展进程中发挥着重要功能。此外,高丰度、高稳定性和高特异性预示其在临床分子标志物(biomarker)研究中具有高潜在价值。

康成生物基于Illumina高通量测序平台及Arraystar独家授权的数据分析体系,推出特色的small RNAs测序系列服务,包括microRNA测序、tRF&tiRNA测序、sdRNA测序、piRNA测序和small RNA(>60nt)测序。针对以上不同类型的小RNA分子,我们提供从样品处理到数据分析的一站式服务。针对特定类型分子“量身订做”的数据分析可以帮助客户快速开展相应的生物学功能研究。

与常规小RNA测序相比,康成特色的small RNAs测序系列服务具有覆盖种类全、数据分析特异性强等优势。常规的混合小RNA测序一般不能覆盖全部小RNA分子(如下图),其通用的数据分析方法也并不适合所有类型的小RNA。康成特色的small RNAs测序系列服务包含了迄今为止所有已知的小RNA分子类型,并针对每种类型,专门开发了相应的数据分析方法。此外,Arraystar新推出的一系列小RNA qPCR array已经非常成熟,作为Arraystar中国地区的唯一代理商,康成独家提供技术服务,与我们特色的测序系列服务相结合,助力您深入挖掘小RNA。

图释:A :piRNA和miRNA在PAGE凝胶上的片段分布区域十分接近。B:同时对这两片段区域的RNA进行测序,很容易发生piRNA和miRNA的reads彼此重叠,这对二者尤其是piRNA的测序结果造成严重干扰。此外,其他小RNA分子的reads数不足2%,不足以进行分析。康成特色的small RNAs测序系列服务能够分别有效的覆盖相应的小RNA分子种类。


* sdRNA-Seq服务不包括原始数据分析。

microRNA是一类大小为21-23nt的非编码小RNA分子,通过沉默或降解其靶点mRNA分子调控基因表达。microRNA在正常发育过程以及疾病发生过程中具有重要的作用。

康成生物为您提供一站式microRNA测序服务,提供直接可用的数据报告及Paper级结果图表。我们的标准报告涵盖其他服务商没有或者仅作为可选项的高级分析项目,助力您深入microRNA研究。
 
tRNA是非编码小RNA分子的主要来源。tRNA来源的RNA片段(tRF)和tRNA半分子(tiRNA)的生物发生是一个精确调控的过程,其含量有时甚至超过microRNA,具有独特而多样的功能。

康成生物率先推出tRF&tiRNA高通量测序,使用Arraystar独家授权的分析系统,提供从样品到数据分析的一站式技术服务。
 
sdRNA测序技术服务
sdRNA是来源于核仁小RNA (snoRNA) 的一类小RNA分子,其大小与miRNA 类似,分为两种类型。sdRNA可能调控RNA选择性剪接,或同miRNA一样结合AGO蛋白以抑制靶基因的表达。最新研究发现,sdRNA与肿瘤发展进程和恶性迁移密切相关。

类似于tRF/tiRNA测序流程,康成生物sdRNA-Seq技术服务可为客户提供:优化的sdRNA测序方法学;已知sdRNA序列及其前体snoRNA 的注释信息;从所有数据库收集的snoRNA注释信息。sdRNA-Seq服务目前尚不包含原始数据分析。
 
piRNA测序技术服务
piRNA是一类长度约26-32nt的小非编码RNA分子,通过与Piwi蛋白家族成员作用发挥功能。与miRNA数目只有几百种不同,piRNA在人、小鼠、大鼠中广泛表达。piRNA在长度、表达类型、基因结构和生成方式上均与miRNA截然不同。在功能上,piRNA在生殖发育和精子形成过程中保护精子基因组免受转座子插入的危害,通过表观遗传调控基因表达,蛋白翻译和mRNA 更新,以及维持染色质结构和细胞周期进程,并与癌症进程有关。

康成生物提供多种模式piRNA测序服务,满足不同客户的研究需求:可同时对piRNA和miRNA两种分子进行检测,共同进行数据比对、注释和分析;也可仅对piRNA进行检测,精确的片段筛选能够保证覆盖所有piRNA,并为客户提供piRNA专有的数据分析。康成生物还为piRNA含量较低样品提供可选的piRNA富集服务,去除非piRNA后,再进行后续实验。
 
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